hidden - assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval
Date of registration:
10.11.2014
Date of assignment:
10.11.2014
Date of electronic submission:
01.05.2016
Date of proceeded defence:
30.05.2016
Opponents:
Mgr. Aleš Horák, Ph.D.
Preliminary scope of work
Cílem práce je analyzovat volně dostupná a během práce získaná molekulární data prasinofytních řas za účelem sestrojení fylogenetického stromu bohatého na prasinofytní zástupce, který by pomohl odhadnout, jaká z prasinofytních skupin je nejblíže příbuzná plastidu euglenidů. Zaměřovat se budeme především na geny kódované v plastidovém genomu (16S rRNA, RubisCO a další). Data bude řešitelka získávat z věřejně dostupných databází a z envinmentálních vzorků pomocí specifických primerů.
Preliminary scope of work in English
The aim of the thesis is to analyze molecular data of prasinophyte algae either freely available or generated during the work. These data will be used to construct a phylogenetic tree rich with prasinophyte taxa, which could help to estimate which lineage is the most related to the plastid of euglenids. We will focus primarily on genes encoded in the plastid genome ( 16S rRNA RubisCO and others). The data will be obtained from public databases and envinmentálních samples using specific primers.