Kombinovaný QM/MM popis interakcí organokovových komplexů aktivních v léčbě rakoviny s oligomerními modely DNK, RNK a bílkovin
| Thesis title in Czech: | Kombinovaný QM/MM popis interakcí organokovových komplexů aktivních v léčbě rakoviny s oligomerními modely DNK, RNK a bílkovin |
|---|---|
| Thesis title in English: | Combined QM/MM decsription of interaction organometallic complexes active in anticancer treatment with oligomer models of DNA, RNA, and proteins |
| Key words: | organokovové komplexy|DNK|RNK|proteiny|protirakovinné účinky|DFT|QM/MM |
| English key words: | organometallic complexes|DNA|RNA|proteins|anti-cancer treatment|DFT|QM/MM |
| Academic year of topic announcement: | 2022/2023 |
| Thesis type: | diploma thesis |
| Thesis language: | |
| Department: | Department of Chemical Physics and Optics (32-KCHFO) |
| Supervisor: | prof. RNDr. Ing. Jaroslav Burda, DrSc. |
| Author: |
| Guidelines |
| Práce bude založena na kombinovaných kvantově-mechanických/molekulárně-mechanických výpočtech tzv. "piano-stool" Ru(II) komplexů, u kterých byly nalezeny protirakovinné účinky. Pro tyto komplexy budou vypočteny termodynamická data, které hrají klíčovou úlohu při aktivaci a interakci léčiv s DNK/RNK sekvencemi. Zvolené komplexy budou nejprve podrobeny geometrické optimalizaci a pro finální struktury budou provedeny analýzy vlnových funkcí resp. elektronové hustoty pomocí různých výpočetních kvantově-mechanických programů. |
| References |
| 1. R. Polák, R. Zahradník: Základy kvantové chemie, SNTL Praha, 1993
2. P. Čárský, M. Urban: Ab initio výpočty v chemii, SNTL Praha, 1988 3. J. Fišer: Úvod do kvantové chemie, Academia Praha, 1983 4. N. Ostlund, A. Szabo: Modern Quantum Chemistry, McGraw-Hill Inc. New York, 1989 5. Yang, Parr: Density functional Theory, Wiley, NY, 1998 |