Doktorský projekt bude zaměřen na molekulární genetiku a buněčnou biologii zástavy spermatogeneze mezidruhových hybridů myší. Hybridní sterilita je univerzální fenomén spojený se speciací tak odlišných organismu, jako jsou kvasinky, rostliny, hmyz, ptáci nebo savci. V posledních deseti letech byl dosažen významný pokrok v genetické analýze hybridní sterility včetne objevu Prdm9, prvního genu hybridní sterility obratlovců, který by učiněn v laboratoři školitele. Doktorandka bude identifikovat nové geny hybridní sterility pozičním klonováním a za použití chromozomálních substitučních kmenů. Bude studovát funkci genů, které se podílí na párování a synapsi homologních chromozomů a meiotické rekombinaci v pachytenním stadiu primárních spermatocytů a oocytů a jejich úlohu v hybridní sterilitě. Ve své práci bude užívat kombinaci metod DNA RNA sekvenování a amplifikace, imunofluorescenční detekce specifickách proteinů na meiotických spreadech, RNA a DNA FISH a genetického mapování.
Preliminary scope of work in English
The project will be focused on molecular genetics and cell biology of spermatogenic arrest in interspecific mouse hybrids. Hybrid sterility is a universal phenomenon participating in speciation of such diverse species as yeast, plants, insects, birds or mammals. In the last ten years fundamental progress in genetic analysis of hybrid sterility has been achieved, including the discovery of the first mammalian hybrid sterility gene, Prdm9, in the laboratory of the supervisor. Student will participate in identification of new genes of hybrid sterility by positional cloning, using chromosome substitution strains. She will study the functions of the genes controlling pairing and synapsis of homologous chromosomes and meiotic recombination at the pachytene stage of primary spermatocytes and oocytes, and their role in hybrid sterility. In her work she will use combination of DNA and RNA sequencing and amplification, immunofluorescence methods for detection of specific proteins on meiotic spreads, RNA and DNA FISH and genetic mapping.
- assigned by the advisor