Kombinovaný QM/MM popis interakcí organokovových léčiv na bázi 'piano-stool' Ru(II) komplexů s oligomerními modely DNK
| Thesis title in Czech: | Kombinovaný QM/MM popis interakcí organokovových léčiv na bázi 'piano-stool' Ru(II) komplexů s oligomerními modely DNK |
|---|---|
| Thesis title in English: | Combined QM/MM decsription of interaction of Ru(II) 'piano-stool' organometallic complexes with oligomer models of DNA |
| Key words: | organorutheniové komplexy, quinolon, protirakovinné účinky, DFT |
| English key words: | organoruthenium complexes, quinolone, anti-cancer treatment, DFT |
| Academic year of topic announcement: | 2011/2012 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Chemical Physics and Optics (32-KCHFO) |
| Supervisor: | prof. RNDr. Ing. Jaroslav Burda, DrSc. |
| Author: | hidden - assigned and confirmed by the Study Dept. |
| Date of registration: | 06.11.2011 |
| Date of assignment: | 07.11.2011 |
| Confirmed by Study dept. on: | 16.04.2012 |
| Date and time of defence: | 19.06.2012 00:00 |
| Date of electronic submission: | 28.05.2012 |
| Date of submission of printed version: | 28.05.2012 |
| Date of proceeded defence: | 19.06.2012 |
| Opponents: | RNDr. Vladimír Sychrovský, Ph.D. |
| Guidelines |
| Práce bude založena na kombinovaných kvantově-mechanických/molekulárně-mechanických výpočtech tzv. "piano-stool" Ru(II) komplexů, u kterých byly nalezeny protirakovinné účinky. Pro tyto komplexy budou vypočteny termodynamická data, které hrají klíčovou úlohu při aktivaci a interakci léčiv s DNK/RNK sekvencemi. Zvolené komplexy budou nejprve podrobeny geometrické optimalizaci a pro finální struktury budou provedeny analýzy vlnových funkcí resp. elektronové hustoty pomocí různých výpočetních kvantově-mechanických programů. |
| References |
| 1. R. Polák, R. Zahradník: Základy kvantové chemie, SNTL Praha, 1993
2. P. Čárský, M. Urban: Ab initio výpočty v chemii, SNTL Praha, 1988 3. J. Fišer: Úvod do kvantové chemie, Academia Praha, 1983 4. N. Ostlund, A. Szabo: Modern Quantum Chemistry, McGraw-Hill Inc. New York, 1989 5. Yang, Parr: Density functional Theory, Wiley, NY, 1998 |