Biogeografie a specifita fotobiontů rodu Asterochloris

• Thesis title in Czech: Biogeografie a specifita fotobiontů rodu Asterochloris
• Thesis title in English: Biogeography and specificity of Asterochloris photobionts
• Key words: biogeografie, řasa, Asterochloris, fotobiont, symbiósa, ekologie, fylogenetický signál
• English key words: biogeography, algae, Asterochloris, photobiont, symbiosis, ecology, phylogenetic signal
• Academic year of topic announcement: 2009/2010
• Thesis type: diploma thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Botany (31-120)
• Supervisor: doc. Mgr. Pavel Škaloud, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 11.11.2009
• Date of assignment: 12.11.2009
• Date of electronic submission: 09.05.2012
• Date of proceeded defence: 28.05.2012
• Opponents: doc. Jan Vondrák, Ph.D.

Preliminary scope of work

- Sběr stélek lišejníku Cladonia macilenta na území ČR, s preferencí na různorodá stanoviště (např. výsypky versus přirozený les).
- Stanovení diverzity fotobiontů uvnitř stélek na základě sekvenování ITS rDNA markeru (již proběhlo v rámci bakalářské práce). Selekce stélek obsahujících několik (preferenčně dva) genotypů fotobionta.

- Získání stélek lišejníkových rodů Cladonia a Lepraria z Afriky (již proběhlo), JV Asie (právě probíhá) a Nového Zélandu (proběhne ve spolupráci s Pavlou Urbánkovou).
- Izolace DNA, získání sekvencí ITS rDNA a intronu v genu pro aktin fotobionta pomocí řasově specifických primerů.