Analýza křivek dohasínání fluorescence metodou maximální entropie
Thesis title in Czech: | Analýza křivek dohasínání fluorescence metodou maximální entropie |
---|---|
Thesis title in English: | Analysis of fluorescence decay curves by the method of maximum entropy |
Academic year of topic announcement: | 2009/2010 |
Thesis type: | diploma thesis |
Thesis language: | |
Department: | Institute of Physics of Charles University (32-FUUK) |
Supervisor: | doc. RNDr. Jaroslav Večeř, CSc. |
Author: |
Guidelines |
1)Nastudovat teoretické základy týkající se vlastností křivek dohasínání intenzity fluorescence a anizotropie fluorescence
2)Zvládnout metody analytických simulací křivek tak aby odpovídaly křivkám reálně naměřeným 3)Seznámit se jak s klasickými parametrickými metodami analýzy, tak i tzv. metodou maximální entropie 4)Aplikovat teoretické znalosti při anlýze komplexních dohasínání intenzity fluorescence 5)Interpretovat dosažené výsledky |
References |
1)Lakovicz J. R., Principles of Fluorescence Spectroscopy, Second Edition, Kluwer Academic/Plenum Publishers, New York, 1999
2)Bevington P. R., Robinson D. K., Data Reduction and Error Analysis for Physical Sciences, Third Edition, Published by McGraw-Hill Companies, New York, 2003 Další podle pokynů vedoucího |
Preliminary scope of work |
Řadu biofyzikálních a biochemických procesů v biologických vzorcích je možno sledovat pomocí tzv. fluorescenčních sond. Základními charakteristikami těchto chromoforů je jejich fluorescenčním spektrum, dále doba, po kterou se nacházejí v excitovaném stavu, tzv. doba života, a též jejich pohyblivost v roztoku. Pomineme-li spektrální vlastnosti sondy, je její časové chování skryto v křivkách dohasínání intenzity fluorescence a anizotropie fluorescence, které je možno měřit po excitaci krátkým světelným impulsem.
Cílem této práce je analýza analyticky generovaných křivek dohasínání fluorescence metodou maximální entropie a její srovnání s klasickou Marquardtovou mrtodou v případech, kdy tyto křivky jsou komplikované a obsahují např. tzv. distribuce dob života nebo sice diskrétní, ale časově velmi blízké komponenty dohasínání. Jedná se o práci teoretickou, zahrnující zejména modelovaní a anlýzu dat na PC, s možností analýzy reálných dat majících vztah k řešenému problému. |