RNA interference u rostlin

• Thesis title in Czech: RNA interference u rostlin
• Thesis title in English: RNA interference in plants
• Key words: RNAi, miRNA, siRNA, rostliny, RdDM, transgeny, umlčování genů
• English key words: RNAi, miRNA, siRNA, Plants, RdDM, Transgenes, Gene Silencing
• Academic year of topic announcement: 2008/2009
• Thesis type: Bachelor's thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Experimental Plant Biology (31-130)
• Supervisor: RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D.
• Author: hidden - assigned and confirmed by the Study Dept.
• Date of registration: 27.11.2009
• Date of assignment: 27.11.2009
• Date of electronic submission: 16.05.2010
• Date of proceeded defence: 10.06.2010
• Opponents: Mgr. Ivan Kulich, Ph.D.

Preliminary scope of work

Vnesení transgenu do rostlinné buňky a ověření jeho integrace do genomu není zárukou jeho stabilní exprese. Na úrovni jednotlivých buněk totiž mnohdy dochází k rozpoznávání transkriptů vnesených genů (jejich degradačních produktů) a vyvolání obranné reakce - RNA interference (silencingu) - vedoucího k cílené degradaci mRNA daného genu (popř. až zastavení transkripce genu v důsledku metylace DNA a změny struktury chromatinu). Tento mechanismus umlčování genové exprese (tzv. silencing) je rostlinami využíván (a možná i původně vytvořen) na ochranu proti virové infekci. Proto se informace o nutnosti umlčet expresi příslušných genů ve formě siRNA šíří mezi sousedními buňkami i prostřednictvím floémového toku na úrovni celé rostliny.
Bakalářská práce by měla přehlednou formou shrnout základní údaje o RNA interferenci a detailněji zpracovat dostupné literární údaje o samovolném či indukovaném umlčování exprese genů a transgenů u rostlin.