Metody separace fosfopeptidu prasečího pepsinu A s detekcí na MALDI-TOF
| Thesis title in Czech: | Metody separace fosfopeptidu prasečího pepsinu A s detekcí na MALDI-TOF |
|---|---|
| Thesis title in English: | Methods of separation of porcine A phosphopetide with MALDI-TOF detection |
| Academic year of topic announcement: | 2006/2007 |
| Thesis type: | diploma thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Analytical Chemistry (31-230) |
| Supervisor: | prof. RNDr. Věra Pacáková, CSc. |
| Author: | hidden - assigned and confirmed by the Study Dept. |
| Date of registration: | 28.11.2007 |
| Date of assignment: | 28.11.2007 |
| Date of electronic submission: | 13.05.2008 |
| Date of proceeded defence: | 13.05.2008 |
| Opponents: | prof. RNDr. Marie Tichá, CSc. |
| Guidelines |
| Zpracování odborné literatury
Experimentální práce na 1. L.F UK v Praze |
| References |
| Literatura
1. R. Hynek: Chem. listy 89, 93 (1995) 2. R. Hynek : disertační práce 3. H. Vaňková : disertační práce 4. C.T.MANT, R.S.HODGES: Analytical HPLC of peptides and R.BISCHOFF: Characterization of proteins Pepetides and Polynucleotides by Mass Spectrometry v knize HPLC of Biological Macromolecules (K.M.Gooding, F.E.Regnier eds.) 5. Z. Kučerová: Proteasy, jejich klasifikace a vývoj ? přednáška 6. Z. Kučerová Separace a purifikace bílkovin-přednášky |
| Preliminary scope of work |
| Onemocnění žaludku patří mezi moderní civilizační choroby. Jedním z nejdůležitějších faktorů v patogenezi peptického vředu a dalších onemocnění žaludku je pepsinová aktivita. V nedávné době byly zjištěny podstatné sou?vislosti mezi kvalitou a kvantitou jednotlivých pepsinogenů a žaludečními chorobami. Hlavním cílem projektu je vypracovat rychlou metodu pro detekci patologických změn bílkovin a tím umožnit detekovat ranná stadia rakoviny žaludku. K tomuto účelu použijeme vysokoúčinné separační metody.
Předpokladem je ovšem znalost struktury biopolymerů. Jednou z možností je metoda peptidového mapování s detekcí hmotnostní spektrometrií. Pepsiny budou štěpeny ?-chymotrypsinem, případně proteasou V8 a vzniklé peptidy budou separovány pomocí HPLC a detekovány jednak UV-detektorem a jednak na hmotnostním spektrometru. Vyvinuté metody budou optimalizovány jak z hlediska separace, tak detekce. Projekt je řešen ve spolupáci s 1. LF UK |