Studium struktury a dynamiky proteinů viru M-PMV
| Thesis title in Czech: | Studium struktury a dynamiky proteinů viru M-PMV |
|---|---|
| Thesis title in English: | Investigation of structure and dynamics of proteins of M-PMV virus |
| Academic year of topic announcement: | 2007/2008 |
| Thesis type: | diploma thesis |
| Thesis language: | |
| Department: | Department of Low Temperature Physics (32-KFNT) |
| Supervisor: | doc. RNDr. Jan Lang, Ph.D. |
| Author: |
| Preliminary scope of work |
| M-PMV (Mason-Pfizerův opičí virus) patří mezi retroviry a způsobuje selhání imunity, i když působí poněkud odlišným mechanismem než HIV nebo jeho opičí forma SIV. Predmětem studia budou predevším různě mutované formy matrixového proteinu. Tento protein má nezastupitelnou roli při sestavování virové částice. Jeho jediná cílená mutace dokáže změnit místo skládání nezralé virové částice z cytoplazmy na buněčnou membránu, a tedy významně modifikovat životní cyklus viru. Tento efekt je patrně způsoben změnou vazby proteinu k molekulárnímu motoru.
Cílem práce je zmapovat dynamické chování základní kostry proteinu a korelovat je se schopností vazby k molekulárnímu motoru. K tomu bude použito měření podélné a příčné relaxace v roztoku na vzorcích uniformě značených 15N nebo 15N a 13C. Při měření se používá nejmodernějších vícedimenzionálních metod dvojité a trojité resonance (1H, 15N, 13C) a gradientního potlačování silného signálu H2O. V rámci bakalářské práce se předpokládá seznámení experimentální technikou a provedení úvodních experimentů, v případě diplomové práce pak již rozsáhlejší experimentální práce následovaná detailní interpretací výsledků. Detaily viz http://physics.mff.cuni.cz/kfnt/nmr |