Study of light-harvesting antennae based on bacteriochlorophyll aggregates
| Thesis title in Czech: | Studium světlosběrných antén na bázi bakteriochlorofylových agregátů |
|---|---|
| Thesis title in English: | Study of light-harvesting antennae based on bacteriochlorophyll aggregates |
| Key words: | chlorosom, samoorganizace, optická spektroskopie |
| English key words: | chlorosome, self-assembly, optical spectroscopy |
| Academic year of topic announcement: | 2006/2007 |
| Thesis type: | dissertation |
| Thesis language: | angličtina |
| Department: | Department of Chemical Physics and Optics (32-KCHFO) |
| Supervisor: | doc. RNDr. Jakub Pšenčík, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned and confirmed by the Study Dept. |
| Date of registration: | 11.11.2006 |
| Date of assignment: | 11.11.2006 |
| Date and time of defence: | 10.10.2011 10:00 |
| Date of electronic submission: | 03.08.2011 |
| Date of submission of printed version: | 03.08.2011 |
| Date of proceeded defence: | 10.10.2011 |
| Opponents: | doc. RNDr. Vlastimil Fidler, CSc. |
| Prof. Teodor Silviu Balaban | |
| Advisors: | prof. RNDr. Jan Hála, DrSc. |
| Guidelines |
| 1) Zvládnout práci s chlorosomy a přípravu bakteriochlorofylových agregátů. Testovat možnosti přípravy složených agregátů obsahujících navíc např. karotenoidy, chinony nebo lipidy. K charakterizaci vzorků používat absorpční spektroskopii a fluorescenční spektra měřená za aerobních a anaerobních podmínek.
2) Navrhnout a provést experimenty, jejichž smyslem bude získat nové poznatky o mechanismu zhášení excitace v chlorosomech za přítomnosti kyslíku metodami optické spektroskopie. 3) Optimalizovat stávající aparaturu na měření absorpčních diferenčních spekter s nanosekundovým rozlišením tak, aby s její pomocí bylo možné studovat tripletní stavy karotenoidů. |
| References |
| 1. Nepraš M, Titz M: Základy teorie elektronových spekter (1983) SNTL - Nakladatelství technické literatury, Praha.
2. Prosser V a kolektiv: Experimentální metody biofyziky (1989) Academia, Praha 3. Amesz J, Hoff AJ (eds.): Biophysical Techniques in Photosynthesis (1996) Kluwer Academic Publishers, Dordrecht 4. Blankenship RE: Molecular Mechanisms of Photosynthesis (2002) Blackwell Science, Oxford 5. Grimm B, Porra RJ, Rüdiger W, Scheer H (eds.) Chlorophylls and Bacteriochlorophylls Biochemistry, Biophysics, Functions and Applications (2006) Springer 6. odborné články |
| Preliminary scope of work |
| Světlosběrné systémy zelených fotosyntetických bakterií, tzv. chlorosomy, se vyznačují unikátními vlastnostmi, které jsou do značné míry dány spontánní agregací bakteriochlorofylových molekul. Agregáty s velmi podobnými vlastnostmi mohou být připraveny také v laboratoři a představují perspektivní systémy pro umělou fotosyntézu a molekulární elektroniku.
Obsahem práce bude studium různých aspektů bakteriochlorofylových agregátů v chlorosomech a v uměle vytvořených světlosběrných anténách, zejména metodami optické spektroskopie. Některé problémy budou studovány ve spolupráci se zahraničními pracovišti. Cílem práce je objasnění struktury, organizace a funkce těchto antén a prozkoumání možností jejich využití v praxi. Konkrétně se bude jednat např. o studium mechanismu zhášení excitace, ke kterému dochází v chlorosomech za přítomnosti kyslíku. Studovány budou jak přírodní, tak uměle připravené systémy. |
| Preliminary scope of work in English |
| Study of light-harvesting antennae based on bacteriochlorophyll aggregates |