Stanovení pufrační kapacity cytosolu bakterií

• Thesis title in Czech: Stanovení pufrační kapacity cytosolu bakterií
• Thesis title in English: Measurement of bacterial cytosol buffering capacity
• Academic year of topic announcement: 2005/2006
• Thesis type: Bachelor's thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Institute of Physics of Charles University (32-FUUK)
• Supervisor: RNDr. Eva Urbánková, Ph.D.
• Author: hidden - assigned and confirmed by the Study Dept.
• Date of registration: 04.01.2006
• Date of assignment: 04.01.2006
• Date and time of defence: 27.06.2006 00:00
• Date of electronic submission: 27.06.2006
• Date of proceeded defence: 27.06.2006
• Opponents: doc. RNDr. Jaroslav Večeř, CSc.

Guidelines

1. Vyhledat v literatuře metody stanovení pufrační kapacity použitelné u bakteriálních buněk.
2. Zvládnout základy kultivace bakterií (E.coli) a metodu měření vnitrobuněčného pH pomocí fluorescence zeleného fluorescenčního proteinu (pHluorine).
3. Proměřit pufrační kapacitu cytosolu bakterií za různých podmínek (kmeny E. coli nesoucí mutace transportního proteinu MntH, různá vnější pH, nerespirující buňky).

References

Roos, Boron: Intracellular pH (1981) Physiol. Rev. 61: 296-434, kapitola IX: Intracellular buffering

Preliminary scope of work

Jedna z metod používaných na našem pracovišti je měření transportu protonů přes plasmatickou membránu bakterií. Tento transport je kvantifikován měřením změn vnitrobuněčného pH. Kvalitní znalost pufrační kapacity cytosolu bakterií by pomohla kalibrovat měřené změny pH na množství protonů přenesených přes plasmatickou membránu. Řešitel se seznámí se zásadami práce v mikrobiologické laboratoři a aplikacemi fluorescenčních metod v biologii.