| Thesis title in Czech: | DSPII:Personalizovaná medicína a její přístup založený na analýze interakcí imunitního systému a mikrobioty jako nástroj k predikci terapeutické odpovědi na inhibitory IL-17 a IL-23 u pacientů s psoriázou.(práce určená pro zimní kolo přijímacího řízení) |
|---|---|
| Thesis title in English: | DSPII:Personalized medicine and its approach based on the analysis of immune system–microbiota interactions as a tool for predicting therapeutic response to IL-17 and IL-23 inhibitors in patients with psoriasis. |
| Key words: | psoriáza, biologická léčba, mikrobiota,personalizovaná medicína |
| English key words: | psoriasis, biologic therapy, microbiota,personalized medicine |
| Academic year of topic announcement: | 2025/2026 |
| Thesis type: | dissertation |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Cell Biology (31-151) |
| Supervisor: | RNDr. Zuzana Jirásková Zákostelská, Ph.D. |
| Author: | |
| Study form: | full-time |
| Advisors: | RNDr. Štěpán Coufal, Ph.D. |
| Preliminary scope of work |
| Cílem disertační práce je ověřit, zda specifické složení střevní mikrobioty u pacientů s psoriázou moduluje slizniční imunitní systém střeva, zejména Th17 odpověď, a jak se tyto změny promítají do patogeneze onemocnění a účinnosti biologické léčby. Projekt se zaměří na identifikaci bakteriálních konsorcií, druhů a funkčních znaků charakteristických pro psoriázu, na průzkum mikrobiálních autoantigenů v séru a na hledání sérových biomarkerů predikujících (ne)odpověď či „superodpověď“ na terapii. Integrovanou analýzou klinických, sekvenačních a imunologických dat bude vyvinut rámec pro predikci terapeutické odpovědi. Doplňkově bude zkoumána role obezity a kožního i střevního mikrobiomu s využitím prostorové transkriptomiky a gnotobiotických modelů. Hlavní cíle 1. Identifikovat mikrobiální znaky psoriázy: Konsorcia, konkrétní bakterie a funkční (genové/metabolické) znaky asociované s psoriázou a jejich možná kauzální role v patogenezi. 2. Mapovat imunitní dopady mikrobioty: Vztah mezi střevní mikrobiotou, integritou střevní bariéry a Th17 odpovědí; detekce mikrobiálních autoantigenů v séru. 3. Najít prediktivní sérové biomarkery: Markery předpovídající neodpověď, nežádoucí účinky a naopak „superodpověď“ na biologickou léčbu. 4. Integrovat multimodální data pro predikci léčebné odpovědi: Korelace biomarkerů s klinickými ukazateli a multi-omics daty a tvorba prediktivních modelů. 5. Zhodnotit roli obezity a kožního/střevního mikrobiomu: Vliv obezity a kožního vs. střevního mikrobiomu na lokální i systémovou imunitu pomocí prostorové transkriptomiky a gnotobiotických přístupů. Zaměstnavatel: Mikrobiologický ústav AV ČR; typ financování doktorského příjmu 50% zaměstnavatel/50% fakulta |
| Preliminary scope of work in English |
The aim of the dissertation is to determine whether the specific composition of the intestinal microbiota in patients with psoriasis modulates the mucosal immune system of the gut, particularly the Th17 response, and how these changes contribute to disease pathogenesis and the effectiveness of biological therapy. The project will focus on identifying bacterial consortia, species, and functional characteristics typical of psoriasis, investigating microbial autoantigens in serum, and identifying serum biomarkers predicting non-response or “super-response” to treatment. By integrating clinical, sequencing, and immunological data, a framework for predicting therapeutic outcomes will be developed. Additionally, the role of obesity and the skin and gut microbiome will be examined using spatial transcriptomics and gnotobiotic models. Main Objectives Identify microbial features of psoriasis: Characterize immune effects of the microbiota: Identify predictive serum biomarkers: Integrate multimodal data to predict treatment response: Assess the role of obesity and the skin/gut microbiome: Employer: Institute of Microbiology of the Czech Academy of Sciences |