Nekódující RNA a jejich využití v genovém inženýrství
| Thesis title in Czech: | Nekódující RNA a jejich využití v genovém inženýrství |
|---|---|
| Thesis title in English: | Non-coding RNAs and their use in genetic engineering |
| Key words: | bridge RNA, Cas9, Cas12, CRISPR/Cas, IS110, LbCas12a, TIGR-Tas |
| English key words: | bridge RNA, Cas9, Cas12, CRISPR/Cas, IS110, LbCas12a, TIGR-Tas |
| Academic year of topic announcement: | 2024/2025 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Experimental Plant Biology (31-130) |
| Supervisor: | Mgr. Adéla Přibylová, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned and confirmed by the Study Dept. |
| Date of registration: | 24.10.2024 |
| Date of assignment: | 24.10.2024 |
| Confirmed by Study dept. on: | 27.01.2025 |
| Date of electronic submission: | 28.04.2025 |
| Date of proceeded defence: | 03.06.2025 |
| Opponents: | Ing. Vojtěch Hudzieczek, Ph.D. |
| Advisors: | RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D. |
| Guidelines |
| MB140P36 Genové inženýrství MB140P71 Základy molekulární biologie |
| References |
| https://www.nature.com/articles/s41586-024-07552-4#article-info |
| Preliminary scope of work |
| Nekódujíci RNA (NcRNA) hrají podstatnou roli v životě všech buněk. Tyto molekuly nejsou překládány do proteinů a mají široké spektrum funkcí. Podílí se například na procesu RNA interference (RNAi), kterým buňka, mimo jiné, reguluje aktivitu genů; jsou nezbytné pro translaci proteinů (tRNA, rRNA); slouží jako templáty pro syntézu telomer; atd. Nekódující RNA hrají i významnou roli v genovém inženýrství. Napříkald: RNAi pro ovlivnění genové exprese; sgRNA v CRISPR systémech pro navádění katalyticky aktivní či neaktivní endonukleázy do sekvenčně specifického místa DNA; a recentně (06/2024) Bridge RNA umožňující sekvenčně specifické tři základní typy přestaveb DNA - inserci, vyštěpení a inverzi. Cílem práce je literární rešerše, která popíše nejnovější metody využití nekódujícich RNA v genovém inženýrství, především pak Bridge RNA a jeho potenciál v genovém inženýrství. Tato práce je vhodná jako základ pro navazující magisterskou prací, jejímž cílem je zavedení Bridge RNA systému do modelových rostlin. Stránka týmu -> https://natur.cuni.cz/biologie/katedry-a-pracoviste/katedra-experimentalni-biologie-rostlin/veda-a-vyzkum/skupina-molekularni-biologie-rostlin-lukase-fischera |
| Preliminary scope of work in English |
| Non-coding RNAs (ncRNA) play an essential role in the life of all cells. These molecules are not translated into proteins and have a wide range of functions. For example, they are involved in the process of RNA interference (RNAi), by which the cell, among other things, regulates gene activity; they are essential for the translation of proteins (tRNA, rRNA); they serve as templates for telomere synthesis; etc. Non-coding RNAs also play an important role in genetic engineering. For example: RNAi for influencing gene expression; sgRNA in CRISPR systems for guiding catalytically active or inactive endonuclease to a sequence-specific DNA site; and most recently (06/2024) Bridge RNAs allowing three basic types of DNA rearrangements in sequence-specific context- insertion, cleavage and inversion. The aim of this thesis is a literature review that will describe the latest methods of using non-coding RNAs in genetic engineering, particularly Bridge RNA and its potential in genetic engineering. This thesis is suitable as a basis for a follow-up Master's thesis aiming to introduce the Bridge RNA system into model plants. Team page -> https://natur.cuni.cz/en/biology/departments-and-work-places/department-of-experimental-plant-biology/research/plant-molecular-biology-group-of-lukas-fischer |