Faktory ovlivňující dynamiku rostlinného aktinového cytoskeletu
| Thesis title in Czech: | Faktory ovlivňující dynamiku rostlinného aktinového cytoskeletu |
|---|---|
| Thesis title in English: | Factors affecting the dynamics of the plant actin cytoskeleton |
| Key words: | Aktin, rostlinná buňka, superrezoluční mikroskopie, Arabidopsis, obrazová analýza |
| English key words: | Actin, plant cell, superresolution microscopy, Arabidopsis, image analysis |
| Academic year of topic announcement: | 2023/2024 |
| Thesis type: | diploma thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Experimental Plant Biology (31-130) |
| Supervisor: | RNDr. Kateřina Schwarzerová, Ph.D. |
| Author: | |
| Advisors: | PharmDr. Jindřiška Angelini, Ph.D. |
| Guidelines |
| MB130P30 Rostlinná Cytologie MB130P47E Plant Cytoskeleton MB100P10 4EU+ Biological Engineering - ImageJ Intensive course |
| References |
| doi: 10.1016/j.pbi.2013.10.012. https://doi.org/10.1016/j.pbi.2010.09.013 https://doi.org/10.1146/annurev-arplant-050213-040327 |
| Preliminary scope of work |
| Aktin je rodina proteinů přítomných ve všech eukaryotických buňkách, kde je schopen polymerizovat a vytvářet mikrofilamenta, jednu z hlavních složek cytoskeletu. V rostlinách jsou aktinová filamenta nezbytná pro transport nákladu mezi buněčnými organelami a pro transport uvnitř i vně plazmatické membrány. Nedávné techniky superrozlišovací mikroskopie odhalily extrémní dynamiku aktinových filament v rostlinné buňce, která polymerují a depolymerují rychlým tempem. O molekulách zodpovědných za regulaci dynamiky rostlinného aktinu však existují jen omezené znalosti. Pomocí pokročilých metod mikroskopie a analýzy obrazu plánujeme změřit, jak je dynamika aktinových filament změněna u rostlin Arabidopsis thaliana mutovaných pro různé proteiny spojené s aktinovými filamenty. Vítáni jsou zejména studenti se zkušenostmi nebo zájmem o práci s programy pro analýzu obrazu. |
| Preliminary scope of work in English |
| Actin is a family of proteins present in about all eukaryotic cells where it is able to polymerize and form microfilaments, one of the main components of the cytoskeleton. In plants, actin filaments are necessary for transporting cargo between cell organelles and for inside and outside the plasma membrane. Recent superresolution microscopy techniques uncovered extreme dynamics of actin filaments in the plant cell, polymerizing and depolymerazing at a fast rate. However, limited knowledge exists concerning the molecules responsible for regulation of plant actin dynamics. Using advanced microscopy and image analysis methods we plan to measure how the dynamics of actin filaments is modified in Arabidopsis thaliana plants mutants for different proteins associated with actin filaments. Students with experience (or interest) in image analysis programs are especially welcome. |