hidden - assigned and confirmed by the Study Dept.
Date of registration:
09.11.2023
Date of assignment:
09.11.2023
Confirmed by Study dept. on:
25.01.2024
Date of electronic submission:
28.04.2025
Date of proceeded defence:
29.05.2025
Opponents:
RNDr. Linda Doubravová, Ph.D.
Preliminary scope of work
Přehled regulace transkripce v různých druzích aktinobakterií. Studentka se zaměří na regulační RNA, které interagují s bakteriálním transkripčním aparátem, zejména na Ms1 RNA z mykobakterií a CoRP RNA, kterou jsme nedávno objevili u corynebakterií. Dále studentka popíše různé typy sigma faktorů, především alternativní sigma faktor sigma B, který se podobá primárnímu sigma faktoru sigma A. Bakalářská práce bude porovnávat regulaci transkripce u různých aktinobakteriálních druhů, které jsou studovány hlavně kvůli metabolickým drahám produkujícím unikátní sekundární metabolity.
Preliminary scope of work in English
An overview of transcriptional regulation in different species of Actinobacteria. The student will focus on regulatory RNAs that interact with the bacterial transcription machinery, namely Ms1 RNA from mycobacteria and CoRP RNA that we have recently discovered in corynebacteria. Next, the student will focus on different types of sigma factors, mainly the alternative sigma factor sigma B, which resembles the primary sigma factor sigma A. The thesis will compare transcription regulation in various actinobacterial species that are intensively studied for their metabolic pathways and production of unique secondary metabolites.