hidden - assigned and confirmed by the Study Dept.
Date of registration:
25.10.2023
Date of assignment:
25.10.2023
Confirmed by Study dept. on:
06.11.2023
Date of electronic submission:
26.04.2025
Date of proceeded defence:
02.06.2025
Opponents:
Ing. Stanislav Vinopal, Ph.D.
Award:
Thesis was put forward for an award
Preliminary scope of work
Základní a pro život nezbytnou vlastností buněk je jejich schopnost fungovat jako otevřený systém, tedy komunikovat s okolním prostředím. Buňky toho dosahují jak selektivní látkovou výměnou s okolím, tak přijímáním a vysíláním řady signálů. Jedním z těchto procesů je příjem materiálu z extracelulárního prostředí neboli endocytóza. Klatrinem zprostředkovaná endocytóza je jedním z nejvíce rozšířených a nejlépe dokumentovaných typů endocytózy u eukaryotických buněk. Selektivnosti klatrinem zprostředkované endocytózy je z velké části dosahováno za pomocí cytosolického adaptorového proteinového komplexu AP-2. Funkční cyklus AP-2 je regulován celou řadou faktorů, jedním z nich je rodina serin-threonin adaptor asociovaných kináz, jejíchž nejlépe popsaným členem u člověka je kináza AAK1. Nejnovější výzkum nicméně naznačuje další role této proteinové rodiny. Předpokládá se, že funkce těchto kináz reguluje přenos signálu, například v rámci drah Wnt, Notch nebo integrinové signalizace, anebo umožňuje vstup některých patogenů do buněk. Tyto přídatné funkce se navíc zdají být částečně nezávislé na vlastní kinázové katalytické aktivitě. Tato zjištění potvrzují také aktuální výsledky naší laboratoře (Knop et.al., 2023) zabývající se funkcí kinázy SEL-5, homologu AAK1 u Caenorhabditis elegans. Cílem diplomového projektu bude analýza vybraných fenotypů u transgenních kmenů C. elegans s mutacemi v SEL-5 a dalších regulátorech buněčného transportu a identifikace ovlivněných signálních drah v konkrétních případech. Hlavními používanými pracovními metodami budou zejména základní a pokročilá genetická analýza u C. elegans a různé typy světelné a fluorescenční mikroskopie s použitím fluorescenčně značených reportérových genů.
- assigned and confirmed by the Study Dept.