Role proteinů LmbF a CcbF v biosyntéze antibiotik linkomycinu resp. celesticetinu a jejich potenciální uplatnění v biosyntéze hybridního antibiotika CELIN
| Thesis title in Czech: | Role proteinů LmbF a CcbF v biosyntéze antibiotik linkomycinu resp. celesticetinu a jejich potenciální uplatnění v biosyntéze hybridního antibiotika CELIN |
|---|---|
| Thesis title in English: | The role of LmbF and CcbF proteins in the biosynthesis of the antibiotics lincomycin and celesticetin and their potential application in the biosynthesis of the hybrid antibiotic CELIN |
| Key words: | linkomycin, celesticetin, hybridní antibiotika, biosyntéza |
| English key words: | lincomycin, celesticetin, hybrid antibiotics, biosynthesis |
| Academic year of topic announcement: | 2022/2023 |
| Thesis type: | diploma thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Genetics and Microbiology (31-140) |
| Supervisor: | RNDr. Markéta Koběrská, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned and confirmed by the Study Dept. |
| Date of registration: | 05.11.2022 |
| Date of assignment: | 08.11.2022 |
| Confirmed by Study dept. on: | 27.01.2023 |
| Date of electronic submission: | 07.08.2024 |
| Date of proceeded defence: | 12.09.2024 |
| Opponents: | RNDr. Jaroslav Nunvář, Ph.D. |
| Preliminary scope of work |
| Linkomycin a celesticetin jsou strukturně příbuzná přírodní linkosamidová antibiotika, jejichž biosyntézy zahrnují několik společných kroků. V nedávno publikované práci (Kadlcik et al, 2017) bylo kombinací enzymů kódujících potřebné kroky in vitro připraveno účinné hybridní antibiotikum celin. Náplní navrhované práce je podíl na cílené modifikaci producenta linkomycinu tak, aby k produkci hybridního antibiotika docházelo in vivo. Vzhedem k tomu, že k diverzifikaci biosyntéz linkomycinu a celesticetinu dochází při reakci katalyzované enzymy LmbF resp. CcbF bude stanoven metabolický profil deleční mutanty dlmbF producenta linkomycinu, testovány interakce proteinu LmbF a CcbF s ostatními proteiny biosyntetického shluku a navrženy další cílené modifikace producenta tak, aby biosyntetická dráha probíhala ve prospěch hybridního antibiotika celin a nedocházelo k produkci linkomycinu. Metodicky práce obnáší širokou škálu technik zahrnující kultivace nepatogenních mikroorganismů, LC-MS analýzy vzorků, test proteinových interakcí, metody izolace a manipulace s DNA. Kadlcik, S., et al. "Elucidation of salicylate attachment in celesticetin biosynthesis opens the door to create a library of more efficient hybrid lincosamide antibiotics." Chemical science 8.5 (2017): 3349-3355 |