Naula, C. M., et al. (2010). A Glucose Transporter Can Mediate Ribose Uptake: Definition of Residues That Confer Substrate Specificity in a Sugar Transporter. Membrane Biology, 285(39), 29721-29728.https://doi.org/10.1074/jbc.M110.106815 Morii, M., et al. (2020). The Dual Function of OsSWEET3a as a Gibberellin and Glucose Transporter Is Important for Young Shoot Development in Rice. Plant and Cell Physiology, 61(11), 1935–1945.https://doi.org/10.1093/pcp/pcaa130 Ludwig, A., et al. (2000). Plant Sucrose-H+ Symporters Mediate the Transport of Vitamin H. Plant and Cell Physiology. https://doi.org/10.1111/j.1365-313X.2000.00900.x
Preliminary scope of work
Membránových transportérů přenášející sacharidy je velká škála v několika proteinových rodinách. Cílem této BP je probádat a popsat metody testování substrátové specifity sacharidových transportérů a sepsat jejich zastoupení u modelových organismů. Zajímavým údajem je spektrum substrátů, které byly testovány, jelikož u některých sacharidových transportérů je publikována schopnost transportovat i jiné sacharidy (e.g. glukózový transportér zvládá přenášet i ribózu) či obskurní molekuly (např. vitamín biotin či fytohormon gibberillin). Navíc velmi častým způsobem přiřknutí substrátové specifity u méně používaných modelových organismů je bioinformatické srovnávání, které nemusí odpovídat strukturním rozdílům a tedy i substrátové specifitě. Z této BP je možné pokračovat na magisterském studiu se zaměřením na rostlinné sacharidové transportéry.
Preliminary scope of work in English
Membrane transporters capable of transporting saccharides are of a large variety in several protein families. The goal of this BP is to investigate and describe methods for testing the substrate specificity of saccharide transporters and to describe their representation in model organisms. An interesting piece of information is the spectrum of substrates that were tested, as the ability to transport other saccharides (e.g. glucose transporter translocating ribose) or even obscure molecules (e.g. vitamin biotin or phytohormone gibberellin) is published for some of them. In addition, a very common way of attributing substrate specificity in less commonly used model organisms is bioinformatic comparison, which may not correspond to structural differences and thus to substrate specificity. From this BP, it is possible to continue on to a master's degree with a focus on plant saccharide transporters.
