hidden - assigned and confirmed by the Study Dept.
Date of registration:
24.10.2022
Date of assignment:
24.10.2022
Confirmed by Study dept. on:
01.02.2023
Date of electronic submission:
15.07.2024
Date of proceeded defence:
04.09.2024
Opponents:
Dr. Michael J. Prigge
Advisors:
Mgr. Monika Kubalová, Ph.D.
Shiv Mani Dubey, M.Sc., Ph.D.
Preliminary scope of work
Fytohormon auxin je v rostlinných buňkách vnímán TIR1/AFB koreceptory. Současné práce ukazují, že tyto koreceptory se nacházejí jak v buněčném jádře, tak v cytoplazmě. Cílem této práce je identifikace proteinů, které jsou součástí cytoplazmatického receptorového komplexu v modelové rostlině Arabidopsis thaliana. Řešitelka této práce bude využívat kombinaci fylogenetických a proteomických metod k identifikaci proteinů, které se pravděpodobně mohou skládat do cytoplazmatického auxinového koreceptoru. V dalším fázi práce bude analyzovat buněčnou lokalizaci a skládání do koreceptoru u vybraných proteinů pomocí tranzientní a stabilní transformace rostlin. Řešitelka během své diplomové práce se tak naučí jak základní metody molekulární biologie, tak stanovení protein-proteinových interakcí a pokročilé mikroskopické techniky.
Preliminary scope of work in English
The TIR1/AFB complex of the phytohormone auxin partitions between the nucleus and the cytoplasm in Arabidopsis cells. The aim of this thesis is to reveal the components of the cytoplasmic auxin receptor. The student will use a combination of phylogenetic and protein-interaction methods to define a set of candidate proteins that might participate in the auxin coreceptor assembly in the cytoplasm. Further, the subcellular localization and assembly into the coreceptor complex of some of these candidate proteins will be analyzed using transient and stable transformation methods. The student will thus cover the basic molecular biology methods, as well as the advanced microscopy and protein-protein interaction techniques.
- assigned and confirmed by the Study Dept.