Hledání selektivních antagonistů konstitutivního androstanového receptoru

• Thesis title in Czech: Hledání selektivních antagonistů konstitutivního androstanového receptoru
• Thesis title in English: An identification of selective antagonists of constitutive androstane receptor
• Key words: Konstitutivní androstanový receptor, pregnanový X receptor, inhibice, genová regulace
• English key words: Constitutive androstane receptor, pregnane X receptor, inhibition, gene regulation
• Academic year of topic announcement: 2022/2023
• Thesis type: diploma thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Pharmacology and Toxicology (16-16170)
• Supervisor: PharmDr. Tomáš Smutný, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 20.10.2022
• Date of assignment: 20.10.2022
• Date and time of defence: 04.06.2024 08:00
• Date of electronic submission: 27.04.2024
• Date of proceeded defence: 04.06.2024
• Opponents: doc. PharmDr. Jana Pourová, Ph.D.

Guidelines

Konstitutivní androstanový receptor (CAR) a pregnanový X receptor (PXR) představují klíčové jaterní transkripční faktory a xenosensory, které jsou regulovány ligandy. Tyto receptory kontrolují expresi mnoha společných genů, mají však také své specifické genové cíle. Rozlišit unikátní funkce receptorů je důležité pro pochopení jejich úlohy ve fyziologických a patofyziologických procesech. Nové selektivní ligandy představují nástroj pro studium specifických funkcí těchto receptorů.

Cílem DP je replikační studie dříve identifikovaných látek v naší vědecké skupině, které vykazují antagonistickou aktivitu vůči CAR receptoru, ale minimálně ovlivňují PXR receptor.

Úkoly:
1. vyhodnotit afinitu testovaných látek k receptoru CAR metodou two-hybrid assay
2. vyhodnotit vliv testovaných látek na aktivitu CAR3 a PXR receptoru metodou gene reporter assay (experiment s využitím expresních vektorů pro CAR3 a PXR a reportérových vektorů CYP2B6 a CYP3A4)

Provést experimentální práci a vyhodnotit výsledky.
Vyhledat relevantní publikace v databázích.
Nastudovat odbornou literaturou k tématu DP.
Sepsat práci v souladu se Závaznými pokyny pro vypracování bakalářských/diplomových prací na Katedře farmakologie a toxikologie.
Dodržovat etiku publikační praxe (klást důraz na principy správného citování).
Sepsat diplomovou práci experimentálního charakteru o délce 40-50 stran, která odkazuje na alespoň 30 literárních pramenů.

References

doi: 10.1124/mol.115.097782
doi: 10.2174/187569209788654005
https://doi.org/10.1016/j.bbagrm.2016.02.013
DOI: 10.1124/mol.62.3.638

Preliminary scope of work

Kultivace HepG2 buněčné linie, transfekce vektorů, treatment, analýza reportérových studií.
Vyhledávání publikací na téma: CAR/PXR a jejich aktivátory/inhibitory.
Krátká literární rešerše tématu.
Pravidelná diskuse problematiky se školitelem.

Preliminary scope of work in English

Cultivation of HepG2 cells, transfection of vectors, treatment, evaluation of reporter studies.
Searching for publications dealing with CAR/PXR and their activators/inhibitors.
Write a short literature review.
A regular discussion with the supervisor.