Single-cell RNA sequencing in leukemia

• Thesis title in Czech: Single-cell RNA sekvenování v leukémii
• Thesis title in English: Single-cell RNA sequencing in leukemia
• Key words: leukémie (AML, CML, ALL, CLL), sekvenování, scRNA-seq, buňky, transkriptom, léčba
• English key words: leukemia (AML, CML, ALL, CLL), sequencing, scRNA-seq, cells, transcriptome, treatment
• Academic year of topic announcement: 2021/2022
• Thesis type: Bachelor's thesis
• Thesis language: angličtina
• Department: Department of Cell Biology (31-151)
• Supervisor: prof. MUDr. Eva Froňková, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval
• Date of registration: 26.11.2021
• Date of assignment: 01.12.2021
• Date of electronic submission: 01.08.2022
• Date of proceeded defence: 02.09.2022
• Opponents: RNDr. Adam Obr, Ph.D.

Preliminary scope of work

Analýza transkriptomů jednotlivých buněk (tzv. single-cell RNA sequencing)
je v současnosti nejrychleji se rozvíjející technologií využívající
sekvenování nové generace. Nejnovější metody kombinují kromě analýzy
transkriptomu i detekci proteinů. Tyto technologie umožňují cílené
zkoumání chování fyziologických i nádorových buněk a jsou již využívány
například v onkologickém výzkumu. Cílem bakalářské práce je zmapovat v
současnosti dostupné metody tohoto typu a popsat specifika jejich využití
u leukemických onemocnění.