Porovnání různých molekulárně-biologických přístupů pro detekci přítomnosti DNA patogenní bakterie Haemophilus influenzae
| Thesis title in Czech: | Porovnání různých molekulárně-biologických přístupů pro detekci přítomnosti DNA patogenní bakterie Haemophilus influenzae |
|---|---|
| Thesis title in English: | Comparison of different molecular-biological approaches for detecting the presence of DNA of the pathogenic bacterium Haemophilus influenzae |
| Key words: | Haemophilus influenzae, polymerázová řetězová reakce (PCR), izotermální amplifikace DNA pomocí smyček (LAMP) |
| English key words: | Haemophilus influenzae, polymerase chain reaction (PCR), isothermal loop mediated DNA amplification (LAMP) |
| Academic year of topic announcement: | 2020/2021 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Biochemistry (31-250) |
| Supervisor: | prof. RNDr. Markéta Martínková, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval |
| Date of registration: | 14.11.2020 |
| Date of assignment: | 16.11.2020 |
| Date of electronic submission: | 16.06.2021 |
| Date of proceeded defence: | 28.07.2021 |
| Opponents: | RNDr. Helena Dračínská, Ph.D. |
| Advisors: | Mgr. Petr Jeřábek, Ph.D. |
| Guidelines |
| Doporučené povinně-volitelné předměty MC250P07B Internet a bioinformatika nebo MC200P02 Základy metod charakterizace chemických látek Doporučené volitelné předměty MC250P21 Moderní metody výzkumu proteinů MC250P30 Bioinformatika |
| References |
| Notomi, T., Okayama, H., Masubuchi, H., Yonekawa, T., Watanabe, K., Amino, N., and Hase, T. (2000) Loop-mediated isothermal amplification of DNA. Nucleic Acids Res. 28, E63 Mori, Y., Nagamine, K., Tomita, N., and Notomi, T. (2001) Detection of loop-mediated isothermal amplification reaction by turbidity derived from magnesium pyrophosphate formation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 289, 150–154 Tomita, N., Mori, Y., Kanda, H., and Notomi, T. (2008) Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) of gene sequences and simple visual detection of products. Nat Protoc. 3, 877–882 |
| Preliminary scope of work |
| Součástí bakalářské práce bude vyhledání dosavadních poznatků o možnostech amplifikace daného úseku DNA v odborné literatuře. Budou porovnány různé molekulárně biologické přístupy detekce genu glpQ bakterie Haemophilus influenzae. Konkrétně se zaměříme hlavně na výhody a nevýhody polymerázové řetězové reakce (z angl. polymerase chain reaction, PCR) a izotermální amplifikace pomocí smyček (z angl. isothermal loop mediated amplification, LAMP). |