V rámci disertační práce bude studována dynamika vybraných proteinů a proteinových komplexů v roztoku. K tomu budou využity techniky hmotnostní spektrometrie jako je chemická modifikace, oxidativní značení nebo vodík/deuteriová výměna. Zaměříme se zejména na použití pulsních technik pro validaci prostorové struktury protilátek, jejich komplexů s antigeny a sledování interakčního rozhraní transkripčních faktorů s dvou vlákennou DNA.
Preliminary scope of work in English
The dissertation will study the dynamics of selected proteins and protein complexes in solution. Mass spectrometry techniques such as chemical modification, oxidative labelling or hydrogen / deuterium exchange will be used for this. We will focus mainly on the use of pulse techniques for the validation of the spatial structure of antibodies, their complexes with antigens and the monitoring of the interaction interface of transcription factors with double-stranded DNA.
- assigned by the advisor