Odhalení molekulárních mechanismů opravy abazického meziřetězcového spojení DNA

• Thesis title in Czech: Odhalení molekulárních mechanismů opravy abazického meziřetězcového spojení DNA
• Thesis title in English: Unravelling molecular mechanisms of the abasic crosslink DNA repair
• Key words: DNA, oprava, replikace, krystalografie, enzymologie, NMR spectroscopy
• English key words: DNA repair, replication, crystallography, enzymology, NMR spectroscopy
• Academic year of topic announcement: 2019/2020
• Thesis type: dissertation
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Physical and Macromolecular Chemistry (31-260)
• Supervisor: RNDr. Mgr. Jan Šilhán, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 09.10.2019
• Date of assignment: 09.10.2019
• Date of electronic submission: 21.02.2024
• Date of proceeded defence: 27.03.2024
• Opponents: RNDr. Cyril Bařinka, Ph.D.

Preliminary scope of work

Cílem této práce bude studium molekulárních mechanismů a architektury opravy abazických meziřetězcových spojení DNA. Po přípravě konstruktů a rekombinantních proteinů v bakteriích E. coli bude následovat biofyzikálních charakterizace interakcí a měření enzymových kinetik. Interakční studie budou probíhat za pomocí fluorescenčních technik a elektroforetických metod. Strukturní analýza bude řešena pomocí proteinové X-ray krystalografie a NMR.