Studium interakcí forkhead box O (FOXO) transkripčních faktorů s DNA
| Thesis title in Czech: | Studium interakcí forkhead box O (FOXO) transkripčních faktorů s DNA |
|---|---|
| Thesis title in English: | Study of interactions of forkhead box O (FOXO) transcription factors with DNA |
| Key words: | FOXO4, forkhead, p53, transkripční faktor, protein-protein interakce |
| English key words: | FOXO4, forkhead, p53, transcription factor, protein-protein interaction |
| Academic year of topic announcement: | 2019/2020 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Biochemistry (31-250) |
| Supervisor: | prof. RNDr. Tomáš Obšil, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned by the advisor |
| Date of registration: | 07.10.2019 |
| Date of assignment: | 07.10.2019 |
| Date of electronic submission: | 10.08.2020 |
| Date of proceeded defence: | 15.09.2020 |
| Opponents: | RNDr. Jiří Pavlíček, Ph.D. |
| Advisors: | RNDr. Veronika Obšilová, Ph.D. |
| Preliminary scope of work |
| Hlavním cílem tohoto projektu bude objasnění molekulární podstaty interakce mezi transkripčním faktorem a tumorovým supresorem p53 a forkhead transkripčním faktorem FOXO4. Tyto proteiny regulují různé signální kaskády podílející se na kontrole buněčného cyklu, apoptosy a metabolismu. Kromě toho však hrají i klíčovou roli v procesu stárnutí a porucha jejich regulace se podílí na vzniku řady patologických stavů včetně nádorových onemocnění. Nedávno bylo ukázáno, že transkripční faktory p53 a FOXO4 spolu fyzicky interagují, přičemž tato interakce hraje klíčovou úlohu v procesu buněčné senescence a lékové rezistence. Nicméně řada aspektů interakce p53 a FOXO4 proteinů je stále nejasná, zejména jaké oblasti DNA-vazebné domény p53 jsou odpovědné za interakci s FOXO4, jestli DNA-vazebná doména p53 také interaguje s transaktivační doménou FOXO4 či jestli tato interakce ovlivňuje vazbu FOXO a p53 na DNA. 1. Příprava rekombinantních FOXO1-DBD, FOXO3-DBD a FOXO4-DBD 2. Porovnání DNA-vazebných afinit připravených FOXO-DBD pomocí FP (polarizace fluorescence) měření. 3. Porovnání DNA-vazebných afinit připravených FOXO-DBD v přítomnosti a nepřítomnosti p53-DBD. |