Rybí modely ve výzkumu nádorů - vývoj mezendodermu a imunitního systému po genetické manipulaci dania a medaky
| Thesis title in Czech: | Rybí modely ve výzkumu nádorů - vývoj mezendodermu a imunitního systému po genetické manipulaci dania a medaky |
|---|---|
| Thesis title in English: | Fish models in cancer research - development of mesendoderm and immune system in danio and medaka via genetic manipulation |
| Academic year of topic announcement: | 2018/2019 |
| Thesis type: | dissertation |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Cell Biology (31-151) |
| Supervisor: | RNDr. Karel Drbal, Ph.D. |
| Author: |
| Preliminary scope of work |
| Rybí modely dostávají stále větší prostor v experimentální manipulaci nádorů a role imunitního systému během tumorigeneze. V této práci se zaměříme na ovlivnění vývoje mezendodermu a jeho vliv na vývoj imunitního systému. Studovaná bude role morfogenů a signálních drah, které se účastní následného vývoje obou zárodečných listů. Paralelní proces probíhá během EMT u nádorů epiteliálního původu. V naší laboratoři se soustředíme na nádory uroteliálního traktu (močový měchýř, ledvina). Genetická manipulace CRISPR/Cas9 a morpholino bude sloužit k perturbaci predikovaných genetických sítí a validaci těchto predikcí. K analýze velkých nasbíraných datasetů používáme moderní bioinformatické "machine learning" metody, založené na redukci dimenzionality, včetně vlastního algortimu EmbedSOM. |