Role sekvenčního kontextu v metylaci DNA

• Thesis title in Czech: Role sekvenčního kontextu v metylaci DNA
• Thesis title in English: Role of sequence context in DNA methylation
• Key words: Arabidopsis, epigenetika, chromatin, metyltransferáza, metylace histonu
• English key words: Arabidopsis, epigenetics, chromatine, methyltransferase, histon methylation
• Academic year of topic announcement: 2018/2019
• Thesis type: Bachelor's thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Experimental Plant Biology (31-130)
• Supervisor: RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 28.11.2018
• Date of assignment: 28.11.2018
• Date of electronic submission: 16.08.2019
• Date of proceeded defence: 05.09.2019
• Opponents: Mgr. Marek Širl

Preliminary scope of work

Literární rešerše pojednávající o funkci metylace cytosinu v různých sekvenčních kontextech a způsobech jejího ustavování a udržování, a to především u rostlin.
Známé rostlinné cytosinové metyltransferázy se liší nejen svou schopností metylovat tři základní kontexty (CGH, CHG a CHH), ale i svou preferencí v rámci dílčích podtypů (H=G, T či A).
Role sekvenčního kontextu je následně klíčová i pro interpretaci metylačních značek - vazbu interagujích proteinů.