Analýza vztahu mezi funkcí proteinového komplexu ARP2/3 a exocytózou v rostlinných buňkách

• Thesis title in Czech: Analýza vztahu mezi funkcí proteinového komplexu ARP2/3 a exocytózou v rostlinných buňkách
• Thesis title in English: Analysis of the relationship between the function of the ARP2/3 protein complex and exocytosis in plant cells
• Key words: komplex Arp2/3, rostlinná buňka, aktinový cytoskelet, růst buňky, exocytóza, exocyst, pylová láčka, hypokotyl
• English key words: Arp2/3 complex, plant cell expansion, actin cytoskeleton, exocytosis, exocyst, pollen tube, hypocotyl
• Academic year of topic announcement: 2020/2021
• Thesis type: diploma thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Experimental Plant Biology (31-130)
• Supervisor: RNDr. Kateřina Schwarzerová, Ph.D.
• Author: hidden - assigned and confirmed by the Study Dept.
• Date of registration: 15.02.2021
• Date of assignment: 18.02.2021
• Confirmed by Study dept. on: 18.02.2021
• Date of electronic submission: 12.12.2023
• Date of proceeded defence: 26.01.2024
• Opponents: Mgr. Lukáš Synek, Ph.D.

Preliminary scope of work

Cílem projektu je analyzovat interakce jednotlivých proteinů komplexu Arp2/3 in vitro. Práce je založena na probíhajících experimentech laboratoře, ve kterých jsou produkovány rekombinantní podjednotky komplexu a je studována jejich interakce s dalšími proteiny. V projektu budou využívány purifikované rekombinantní proteiny a metody 2D elektroforézy a koimunoprecipitace. Bude zjišťována interakce s mikrotubuly/tubulinem a aktinovým cytoskeletem, případně dalšími proteiny. Kromě in vitro analýz bude využívána i mikroskopie (především TIRF) pro validaci výsledků in vivo. Výsledky budou vyhodnocovány pomocí obrazové analýzy.
Téma je součástí širšího zaměření laboratoře a běžících grantů na toto téma.