Evoluce auxinového metabolismu, signalizace a transportu v zelené linii (Viridiplantae)

• Thesis title in Czech: Evoluce auxinového metabolismu, signalizace a transportu v zelené linii (Viridiplantae)
• Thesis title in English: The evolution of auxin metabolism, signalling and transport in the green lineage (Viridiplantae)
• Key words: auxin, řasy, evoluce
• English key words: auxin, algae, evolution
• Academic year of topic announcement: 2018/2019
• Thesis type: Bachelor's thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Experimental Plant Biology (31-130)
• Supervisor: RNDr. Jan Petrášek, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval
• Date of registration: 16.11.2018
• Date of assignment: 16.11.2018
• Date of electronic submission: 07.05.2019
• Date of proceeded defence: 04.06.2019
• Opponents: Mgr. Matyáš Fendrych, Ph.D.
• Advisors: Mgr. Roman Skokan, Ph.D.

Preliminary scope of work

Rostlinný hormon auxin hraje nezastupitelnou roli v regulaci rostlinného vývoje a růstu (Adamowski et Friml, 2015), jeho evoluční počátky jsou však dosud zahaleny tajemstvím. V posledních letech bylo dosaženo znatelného pokroku ve výzkumu rostlinné evoluce, především skrze studium mechorostů a zpřístupnění DNA sekvencí bazálnějších rostlinných organismů a následné analýzy genové homologie s vyššími rostlinami (Hori et al., 2014; Nishiyama et al., 2018). Sladkovodní zelené řasy (Charophyta; Lelieart et al., 2012) nyní po vzoru mechorostů očekávají zavedení příslušných modelových organismů, i zde však již bylo dosaženo menšího pokroku (Boot et al., 2012; Ohtaka et al., 2017). Bakalářská práce si klade za cíl formou literární rešerše zmapovat pokroky v porozumění evoluce auxinového metabolismu, signalizace a transportu v zelené linii (Viridiplantae) a zamyslet se nad vhodným směrem dalšího vývoje jejich studia, především v porovnání dostupných modelových organismů sladkovodních zelených řas.

Adamowski, M. & Friml, J. Plant Cell27, 20-32, doi:10.1105/tpc.114.134874 (2015)
Hori, K. et al. Nature Communications5, 9, doi:10.1038/ncomms4978 (2014)
Nishiyama, T. et al. Cell174, 448-464, doi: 10.1016/j.cell.2018.06.033 (2018)
Leliaert, F. et al. Critical Reviews in Plant Sciences31, 1-46, doi:10.1080/07352689.2011.615705 (2012)
Boot, K. J. M., Libbenga, K. R., Hille, S. C., Offringa, R. & van Duijn, B. Journal of Experimental Botany63, 4213-4218, doi:10.1093/jxb/ers106 (2012)
Ohtaka, K., Hori, K., Kanno, Y., Seo, M. & Ohta, H. Plant Physiology174, 1621-1632, doi:10.1104/pp.17.00274 (2017)

Školitel: Jan Petrášek
Konzultant: Roman Skokan