Role řízené tkáňově-specifcké produkce ISWI proteinu Smarca5/Snf2h v myší krvetvorbě.

• Thesis title in Czech: Role řízené tkáňově-specifcké produkce ISWI proteinu Smarca5/Snf2h v myší krvetvorbě.
• Thesis title in English: Role of tissue-specific expression of the ISWI protein Smarca5/Snf2h in murine hematopoiesis.
• Key words: chromatin, Snf2h, Smarca5, ATPáza, myší model, krvetvorba, kmenové buňky, multipotentní progenitory
• English key words: chromatin, Snf2h, Smarca5, ATPase, mouse model, hematopoiesis, stem cells, multipotent progenitors
• Academic year of topic announcement: 2016/2017
• Thesis type: dissertation
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Cell Biology (31-151)
• Supervisor: prof. MUDr. Tomáš Stopka, Ph.D.
• Author: Mgr. Tereza Turková - assigned by the advisor
• Date of registration: 17.10.2016
• Date of assignment: 24.10.2016
• Date of electronic submission: 27.02.2024
• Opponents: prof. MUDr. Jiří Forejt, CSc., DrSc.

Preliminary scope of work

SWI/SNF proteiny interagují s histony a DNA a za spotřeby ATP skládají strukturu chromatinu ve formě nukleosomů. Aktivita těchto chromatin-remodelačních proteinů se účastní replikace, transkripce a genové opravy. Podrodina ISWI je reprezentována ATPázou Smarca5 (Snf2h), jež patří mezi nepostradatelné jaderné enzymy krvetvorných kmenových buněk. Perturbace Smarca5 v myší vedla ke zjištění, že tento protein se účastní regulace transkripce rRNA a může být podkladem ribosomálního stresu. Podstatou projektu je stadium kondicionálního transgenu Smarca5 v a) vývoji krvetvorby, b) ribosomálním stresu. Budou využity experimenty v myších tkáních a dále experimenty na ex vivo explantátech, mimo jiné transgenních embryonálních fibroblastech. Projekt je financován granty GAČR, AZV, MŠMT.

Poznámka ke dni 24.10.2016
Konzultantem tohoto projekt je Mgr. Tomáš Zikmund, který se bude podílet na spoluškolitelství především na úrovní přenosu laboratorních dovedností a designu experimentů.
p. Magistra do aplikace nešlo vložit z důvodu, že nešlo zvolit jako pracoviště 1.LF UK v menu. Věříme, že se závadu podaří vyřešit a p. Magistra do systému vložit.