Součástí výzkumu na 130m hlubokém vrtu v oblasti SOOS (Mariánské lázně) je charakterizace mikrobioty (kultivačně i bez použití kultivace) z různých hloubek. Jádro vrtu je tvořeno porézními sedimenty I méně propustnými horninami. Cíle práce bude studium diverzity a ekologie bakterií a hub. Ekologická část bude zahrnovat poznání zapojení mikrobů do geochemických procesů. Metodicky práce zahrnuje kultivaci, izolaci DNA, RNA, metody NGS (Illumina), kultivace (včetně kultivace při nedostatku vzduchu) a identifikaci hub i bakterií. Práci lze zpracovat jako bakalářskou i diplomovou.