Diverzita a taxonomie zástupců rodu Geastrum ve Střední Americe

• Thesis title in Czech: Diverzita a taxonomie zástupců rodu Geastrum ve Střední Americe
• Thesis title in English: Diversity and taxonomy of members of genus Geastrum in Central America
• Key words: Geastrum, neotropy, Panama, diverzita, kryptické druhy, multigenová fylogeneze
• English key words: Geastrum, neotropics, Panama, diversity, cryptic species, multigene phylogeny
• Academic year of topic announcement: 2015/2016
• Thesis type: diploma thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Botany (31-120)
• Supervisor: doc. Mgr. Ondřej Koukol, Ph.D.
• Author: Mgr. Petr Zehnálek - assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval
• Date of registration: 20.11.2015
• Date of assignment: 20.01.2016
• Date of electronic submission: 15.08.2017
• Date of proceeded defence: 12.09.2017
• Opponents: doc. RNDr. Michal Tomšovský, Ph.D.

Preliminary scope of work

Recentní studie diverzity hub v tropech ukazují na dosud nepopsanou zjevnou i skrytou
diverzitu a to i v případě makromycetů, tj. hub s velkými a nápadnými plodnicemi. V rámci
rodu Geastrum (Phallomycetidae, Agaricomycetes) byly popsány jak nové druhy, tak na
základě molekulárních dat byly definovány kryptické druhy v rámci kosmopolitně
rozšířených druhů definovaných morfologicky. Ve srovnání s ostatními regiony je oblast
Střední Ameriky méně prostudovaná, resp. dobře prosbíraná, ale bez následného důkladného
zpracování materiálu (detailní morfol. a molekulárně genet. studie)
Materiál a metodika:
Materiál bude pocházet z části z vlastních sběrů v Panamě a případně dalších státech Střední
Ameriky (v roce 2015 už proběhla jedna cesta za sběry, nalezeny plodnice 3-4 druhů). Rozsah
cest závisí částečně na úspěšnosti grantového návrhu GAUK. V případě neúspěchu budou
hledány další zdroje na pokrytí cestovních nákladů. Z větší části budou ale použity herbářové
položky z amerických herbářů. Položky z panamského herbáře UNACHI byly již získány,
z herbáře PAN jsou na cestě, o další bude požádána výpůjčka. Celkově se bude jednat o cca
40-50 položek, většinou neurčených do druhu, ale s přesnou lokalizací.
Z plodnice bude extrahována DNA (ZR F/B DNA kit) a následně budou amplifikovány
oblasti využívané v taxonomii tohoto rodu (ITS rDNA, 28S rDNA, RPB1 a ATP6).
Dosavadní extrakce proběhly úspěšně a to i z herbářových položek. Získané sekvence jsou
poměrně kvalitní a umožňují fylogenetické analýzy. Fylogenetické analýzy budou využívat
metod Maximum Likelihood, Bayesian statistics a Maximum Parsimony.
Na základě výsledků analýz budou definovány monofyletické linie u nichž bude podle
morfologie ověřeno, zda se jedná o kryptické linie v rámci morfologicky definovaných a
uznávaných druhů, nebo o druhy nové, případně o druhy popsané, ale dosud bez známé
fylogenetické pozice.
Pro morfologické studium bude využit optická i skenovací elektronová mikroskopie
(ultrastruktura povrchu peridie a bazidiospor).
Cílem bude zodpovědět minimálně tyto otázky:
1. Jsou linie definované na základě molekulárních dat unikátní pro studovaný region?
2. Je možné najít i morfologické znaky pro popsání kryptických linií jako nové druhy pro
vědu?