Objasnění vlivu proteinkináz ERK1 a ERK2 na iniciaci translace nezávislé na čepičce

• Thesis title in Czech: Objasnění vlivu proteinkináz ERK1 a ERK2 na iniciaci translace nezávislé na čepičce
• Thesis title in English: Elucidation of ERK1 and ERK2 protein kinases effect on cap-independent translation initiation
• Key words: ERK1, ERK2, iniciace translace nezávislá na čepičce, HCV, kináza
• English key words: ERK1, ERK2, cap-independent translation initiation, HCV, kinase
• Academic year of topic announcement: 2014/2015
• Thesis type: diploma thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Genetics and Microbiology (31-140)
• Supervisor: Mgr. Václav Vopálenský, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 14.11.2014
• Date of assignment: 14.11.2014
• Date of electronic submission: 14.08.2016
• Date of proceeded defence: 13.09.2016
• Opponents: Ing. Tomáš Vomastek, Ph.D.

Preliminary scope of work

Hlavním cílem práce je pokusit se charakterizovat možný vliv proteinkináz ERK1/2 na iniciaci translace nezávislou na čepičce. Jako model na čepičce nezávislé iniciace translace bude použito tzv. interní vazebné místo pro ribozom (IRES) z viru hepatitidy typu C (HCV), které je v naší laboratoři dobře etablováno. Řešitel této diplomové práce zavede v naší laboratoři metodu RNA interference, pomocí které bude selektivně umlčovat ERK1 nebo ERK2 proteinkinázu ve vybraných buněčných liniích. Dále bude připraven reportérový RNA konstrukt (reportérový gen pro kontrolou HCV-IRES), který bude paralelně transfekován společně s siRNA do tkáňových linií a bude monitorována případná změna aktivity reportérového proteinu. Pro úspěšné řešení této diplomové práce je nutno zvládnout metodiky RNA interference včetně designu vlastních siRNA, RNA transkripce, transfekce tkáňových kultur, western blot apod.