Mezidruhová variablita gastrointestinální mikrobioty u pěvců

• Thesis title in Czech: Mezidruhová variablita gastrointestinální mikrobioty u pěvců
• Thesis title in English: Interspecific variation of gastointestinal microbiota in passerine birds
• Academic year of topic announcement: 2014/2015
• Thesis type: diploma thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Zoology (31-170)
• Supervisor: Mgr. Jakub Kreisinger, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 05.11.2014
• Date of assignment: 20.11.2014
• Date of electronic submission: 15.08.2016
• Date of proceeded defence: 13.09.2016
• Opponents: Mgr. Klára Vlčková

Preliminary scope of work

Gatrointestinální mikrobiota (GM) ovlivňuje zásadním způsobem fyziologii hostitele mezi něž patří stimulace imunitního systému hostitele, obrana proti některým druhům gastrointestinálních patogenů, efektivita trávení přijímané potravy, přímý vliv na morfologii trávicího traktu, vliv na fungování centrálního nervového systému a vývoj kognitivních vlastností. Většina klíčových studií, které se zabývají funkčními aspektyGM, však byla provedena na lidech a modelových organismech chovaných v zajetí. Současné znalosti o taxonomické a funkční variabilitě GM ve volně žijíchích populacích jsou velmi omezené.
Cílem této práce bude analýza faktorů, které ovlivňují mezidruhovou variabilitu ve složení GM u pěvců. Data o složení GM budou získána pomocí sekvenace 16s rRNA pomocí Illumina MiSeq technologie a následně analyzována pomocí moderních statistických a bioinformatických přístupů.