Species concept in the genus Trentepohlia (Ulvophyceae, Chlorophyta): a combination of molecular and morphological approaches
| Thesis title in Czech: | Definice druhů u rodu Trentepohlia (Ulvophyceae, Chlorophyta) pomocí kombinace molekulárních a morfologických přístupů |
|---|---|
| Thesis title in English: | Species concept in the genus Trentepohlia (Ulvophyceae, Chlorophyta): a combination of molecular and morphological approaches |
| Key words: | druhový koncept, Trentepohlia, aeroterestrické řasy, morfologie, fylogenetika |
| English key words: | species concept, Trentepohlia, subaerial algae, morphology, phylogeny |
| Academic year of topic announcement: | 2013/2014 |
| Thesis type: | diploma thesis |
| Thesis language: | angličtina |
| Department: | Department of Botany (31-120) |
| Supervisor: | doc. Mgr. Pavel Škaloud, Ph.D. |
| Author: | Mgr. Michala Klimešová - assigned by the advisor |
| Date of registration: | 06.10.2014 |
| Date of assignment: | 06.10.2014 |
| Date of electronic submission: | 18.04.2016 |
| Date of proceeded defence: | 30.05.2016 |
| Opponents: | Ladislav Hodač, Dr. |
| Preliminary scope of work |
| Základní data · Rod Trentepohlia představuje výrazného zástupce aerofytických řas. Jeho taxonomie je ale extrémně komplikovaná, stejně jako vymezení jednotlivých druhů. · Rod je v současnosti polyfyletický, promíchaný se zástupci rodu Printzina. · Jednotlivé druhy jsou definovány na základě znaků, které jsou ale většinou velmi plastické, a závisejí na podmínkách prostředí. · Molekulární analýzy poukazují na polyfyletičnost naprosté většiny druhů · Mezi nejdůležitější tradiční determinační znaky patří uspořádání postranních sporangií, tvar a velikost zoosporangií, a relativní proporce prostrátních a vystoupavých vláken. Tyto znaky ale v naprosté většině nelze pozorovat u kultivovaných kmenů · V poslední době bylo publikováno několik studií popisujících diverzitu volně žijících i lichenizovaných zástupců rodu Trentepohlia. Taxonomií a vymezením druhů se ale nikdo nezabývá; výsledné genetické studie pak sestávají z velkého množství neurčených či neurčitelných kmenů. Cíle práce · Molekulární definice Evropských druhů rodu Trentepohlia. --- Jaká je fylogenetická pozice tradičních, morfologicky definovaných druhů? --- Jsou tyto druhy polyfyletické? Pokud ano, která linie ponese jméno daného druhu? Metodika · Sběr vzorků na území ČR, Itálie, popř. i jiných Evropských států · Morfologická charakterizace vzorků. Selekce vzorků s vyvinutými determinačními morfologickými znaky · Izolace DNA pomocí CTAB metody, získání sekvencí rbcL vlastními univerzálními primery · Klonování PCR produktů, sekvenace · Fylogenetické analýzy · Detailní morfologický popis vzorků (kresby, fotky významných struktur) |