Identification and characterization of proteins interacting with plant formins

• Thesis title in Czech: Hledání a charakterizace interakčních partnerů rostlinných forminů
• Thesis title in English: Identification and characterization of proteins interacting with plant formins
• Academic year of topic announcement: 2013/2014
• Thesis type: diploma thesis
• Thesis language: angličtina
• Department: Department of Experimental Plant Biology (31-130)
• Supervisor: prof. RNDr. Fatima Cvrčková, Dr.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 27.11.2013
• Date of assignment: 02.12.2013
• Date of electronic submission: 14.08.2015
• Date of proceeded defence: 15.09.2015
• Opponents: Mgr. Kateřina Abrhámová, Ph.D.
• Advisors: Mgr. Lenka Stillerová

Preliminary scope of work

Cílem práce je identifikovat a charakterizovat nové proteiny interagující s vybranými členy rodiny FH2 proteinů (forminů) Arabidopsis thaliana, zejména s forminy AtFH13 a AtFH14, které jsou typickými zástupci II. třídy rostlinných forminů. Bude proveden screen cDNA knihoven v kvasinkovém dvouhybridním systému s vybranými fragmenty forminů jakožto návnadou, a pomocí tohoto systému budou rovněž testováni kandidáti na interaktory identifikovaní bioinformatickými metodami. V závislosti na výsledcích pak může být provedena další charakterizace nalezených či potvrzených interagujících proteinů (charakterizace mutantů, pokud jsou dostupní ve veřejných sbírkách, konstrukce fluorescentně značených fůzních proteinů a jejich buněčná lokalizace).