Thesis (Selection of subject)Thesis (Selection of subject)(version: 368)
Thesis details
   Login via CAS
Simulation of processes in cellular membranes
Thesis title in Czech: Simulace procesů v buněčných membránách
Thesis title in English: Simulation of processes in cellular membranes
Key words: molekulárně dynamické simulace, molekulární modelování, polarizabilita, biologické membrány, fosfolipidové dvojvrstvy, fosfatidylcholin, transmembránový potenciál, sodík, draslík, vápník
English key words: molecular dynamics simulations, molecular modeling, polarizability, biological membranes, phospholipid bilayers, phosphatidylcholine, transmembrane potential, sodium, potassium, calcium
Academic year of topic announcement: 2013/2014
Thesis type: dissertation
Thesis language: angličtina
Department: Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v.v.i. (32-UOCHAV)
Supervisor: prof. Mgr. Pavel Jungwirth, CSc., DSc.
Author: hidden - assigned and confirmed by the Study Dept.
Date of registration: 27.09.2013
Date of assignment: 27.09.2013
Confirmed by Study dept. on: 27.01.2014
Date and time of defence: 25.09.2018 00:00
Date of electronic submission:09.07.2018
Date of submission of printed version:09.07.2018
Date of proceeded defence: 25.09.2018
Opponents: prof. doc. RNDr. Michal Otyepka, Ph.D.
  Mounir Tarek
 
 
Advisors: Samuli Ollila
Guidelines
Bude upřesněno, podrobnější informace pavel.jungwirth@uochb.cas.cz
References
Bude upřesněno, podrobnější informace pavel.jungwirth@uochb.cas.cz
Preliminary scope of work
Disertační práce se soustředí na molekulové simulace s cílem popsat na molekulové úrovni klíčové procesy spojené s interakcí molekul (včetně fluorescenčních značek) s membránou a přenosem molekul přes buněčnou membránu. Práce se zvlášť soustředí na vliv oxidačního stresu, iontů a specifických membránových peptidů, které se uplatňují při různých nemocech.
Předpokládané znalosti rozsahu magisterského vzdělání v chemické fyzice, biofyzice, či fyzikální chemie. Dobrá znalost angličtiny.
Preliminary scope of work in English
The dissertation will focus on molecular simulations aiming to unravel at the molecular level key processes connected with interactions of molecules (including fluorescence markers) with membranes and translocation across cell membranes. Particular attention is paid to effects due to oxidative stress, ions, and specific membrane-associated peptides and proteins that are involved in numerous human diseases.
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html