Určení expresních profilů miRNA u nádorů hlavy a krku asociovaných a neasociovaných s HPV, miRNA profilování modelového systému izogeních imortalizovaných lidských keratinocytů, analýza dat a jejich porovnání, konfirmace selektovaných miRNA metodou Q RT PCR, průkaz lokalizace selektovaných miRNA pomocí in situ hybridizace, ověřování diferenciálně exprimovaných miRNA na větším počtu nádorů, eventuálně analýza některých identifikovaných miRNA ve funkčních testech.
Preliminary scope of work in English
To establish and characterize the expression profiles of miRNAs in a matched set of HPV dependent and independent head and neck carcinomas, characterization of miRNA expression profiles in a model sets of immortalized isogenic primary human keratinocyte clones of tonsillar and foreskin origin, analyses and comparison of data, verification of the over- or underexpression of miRNAs by quantitative reverse transcript (Q RT) PCR, localization of selected miRNAs in tumor tissues by in situ hybridization, testing of selected miRNAs on a larger set of HNC tumors. Eventually, functional analyses of some identified miRNA.
