Dynamický rozptyl svetla vo svete biomolekúl
| Thesis title in thesis language (Slovak): | Dynamický rozptyl svetla vo svete biomolekúl |
|---|---|
| Thesis title in Czech: | Dynamický rozptyl světla ve světě biomolekul |
| Thesis title in English: | Dynamic light scattering in the world of biomolecules |
| Key words: | dynamický rozptyl světla, biomolekuly, proteiny, cukry |
| English key words: | dynamic light scattering, biomolecules, proteins, carbohydrates |
| Academic year of topic announcement: | 2017/2018 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | slovenština |
| Department: | Institute of Physics of Charles University (32-FUUK) |
| Supervisor: | RNDr. Kateřina Hofbauerová, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned and confirmed by the Study Dept. |
| Date of registration: | 02.10.2017 |
| Date of assignment: | 06.10.2017 |
| Confirmed by Study dept. on: | 23.10.2017 |
| Date and time of defence: | 13.09.2018 09:00 |
| Date of electronic submission: | 19.07.2018 |
| Date of submission of printed version: | 19.07.2018 |
| Date of proceeded defence: | 13.09.2018 |
| Opponents: | RNDr. Mgr. Lucie Bednárová, CSc. |
| Advisors: | RNDr. Vladimír Kopecký, Ph.D. |
| Guidelines |
| 1. Seznámit se s principy dynamického rozptylu světla (dynamic light scattering – DLS).
2. Vypracovat základní rešerši na téma studium proteinů a jejich komplexů pomocí DLS. 3. Prakticky zvládnout měření na analyzátoru částic pomocí DLS. 4. Nalézt optimální podmínky pro měření velikostí různých typů biomolekul pomocí DLS. 5. Identifikovat a kvantifikovat parametry ovlivňující přesnost měření DLS biomolekul. |
| References |
| T. M. Bergfors (ed.): Protein Crystallization: Techniques, strategies and tips, International University Line, La Jolla 1999.
Zetasizer Nano – Příručka uživatele, Malvern 2007. |
| Preliminary scope of work |
| Měření velikostí částic patří v současných laboratořích ke standardním měřením. Ve světě biomolekul však takové měření nabývá na důležitosti, neboť stanovení velikostí např. proteinů může být klíčové pro krystalizační experimenty. Moderní analyzátory dynamického rozptylu světla ale dosahují takových přesností, že je možné stanovit i přibližný tvar biomolekul pouze na základě detekce rozptýleného záření, což umožňuje například odhadnout multimerní strukturu proteinových komplexů, jejíž pochopení je důležité jak pro funkci toho kterého proteinu, tak i pro návrh nových léků cílených na danou bílkovinu.
Náplní bakalářské práce by měla být série měření různých biomolekul, především proteinů, pomocí analyzátoru částic Zetasizer Nano (Malvern), která by měla odhalit parametry ovlivňující přesnost měření a určit i možnosti měření různých biomolekul s ohledem na jejich velikost a tvar. |