Thesis (Selection of subject)Thesis (Selection of subject)(version: 368)
Thesis details
   Login via CAS
Populační genomika a speciace u slavíků
Thesis title in Czech: Populační genomika a speciace u slavíků
Thesis title in English:
Academic year of topic announcement: 2013/2014
Thesis type: dissertation
Thesis language:
Department: Department of Zoology (31-170)
Supervisor: RNDr. Radka Reifová, Ph.D.
Author:
Preliminary scope of work
Hledáme magisterského a/nebo doktorského studenta se zájmem o evoluční genomiku a bioinformatiku. Nabízená práce bude zaměřena na studium genetických aspektů speciace (tj. vzniku druhů) na modelu dvou blízce příbuzných pěvců, slavíka obecného a slavíka tmavého. Naše předchozí výsledky ukázaly, že v reprodukční izolaci mezi oběma druhy slavíků hraje klíčovou roli pohlavní chromosom Z. Cílem nabízeného projektu bude detailní analýza genetického polymorfismu podél chromosomu Z za použití „next-generation“ sekvenčních dat, která již máme k dispozici. Výsledky nám pomohou odhalit konkrétní oblasti na chromosomu Z, které se podílejí na vzniku reprodukční izolace u slavíků. Zjistíme také, do jaké míry je za vznik reprodukční izolace odpovědná rychlejší adaptivní evoluce na chromosomu Z. Student bude odpovědný za bioinformatickou část projektu, která zahrnuje základní analýzy získaných sekvenčních dat, a popoulačně genetické analýzy. Kandidát by měl být schopen práce v prostředí linux a měl by mít alespoň základní zkušenost s některým programovacím jazykem (Bash, Python, C/C++, R nebo Java). Biologické vzdělání není nutnou podmínkou. Konzultantem práce bude zkušený bioinformatik, Mgr. Libor Mořkovský (katedra zoologie).
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html