Small Mammals of the Ghardaïa Region of Algeria: Diversity, Ecology, and Relevance for Endemic Leishmaniasis Responsibilities

• Název práce v češtině: Malí savci z oblasti Ghardaïa v Alžírsku: rozmanitost, ekologie a význam pro endemickou leishmaniózu
• Název v anglickém jazyce: Small Mammals of the Ghardaïa Region of Algeria: Diversity, Ecology, and Relevance for Endemic Leishmaniasis Responsibilities
• Klíčová slova: malí savci, Ghardaïa, leishmaniasis, Leishmania, biodiversity, veřejné zdraví
• Klíčová slova anglicky: Small mammals, Ghardaïa, leishmanióza, Leishmania, biodiverzita, public health
• Akademický rok vypsání: 2025/2026
• Typ práce: disertační práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra zoologie (31-170)
• Vedoucí / školitel: prof. RNDr. Daniel Frynta, Ph.D.
• Forma studia: kombinovaná
• Konzultanti: doc. RNDr. Jovana Sádlová, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Doktorský projekt bude zaměřen na diverzitu a ekologii drobných savců v oblasti Ghardaïy (severní část alžírské Sahary) a jejich vztah k leishmanóze a dalším parazitům v kontextu těchto endemických parazitárních onemocnění. Hlavním cílem je aktualizovat inventář drobných savců v regionu identifikací druhů a zkoumáním jejich prostorové a ekologické distribuce. Kromě toho se projekt snaží vyhodnotit roli těchto druhů jako rezervoárů Leishmanie a dalších potenciálně zoonotických parazitů.
K dosažení těchto cílů budou použity metody odchytu živých drobných savců. Morfologické analýzy vzorků budou prováděny pomocí mikro-CT zobrazení, což umožní detailní studii jejich anatomických znaků. U druhů, které jsou morfologicky obtížně identifikovatelné, bude použita DNA analýza k potvrzení druhové identifikace. K detekci Leishmanie a dalších parazitů budou použity molekulární techniky včetně PCR (polymerázová řetězová reakce). Parazitologické analýzy budou zahrnovat také extrakci a identifikaci prvoků a helmintů spojených s drobnými savci.
Tento výzkum aktualizuje seznam drobných savců a jejich parazitů v oblasti Ghardaïy a poskytne cenná data o jejich distribuci a ekologii. Identifikace a analýza přítomnosti Leishmanie a dalších parazitů u těchto druhů přispějí k hlubšímu pochopení jejich role jako potenciálních rezervoárů a přenašečů. Tyto poznatky rozšíří naše znalosti o ekologických a parazitologických interakcích v této endemické oblasti a podpoří rozvoj strategií pro řízení souvisejících zdravotních rizik.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

This PhD project aims to investigate the diversity and ecology of small mammals in the Ghardaïa region, located in the northern part of the Algerian Sahara, with a focus on their relationship to leishmaniasis and other associated parasites within the context of endemic parasitic diseases. The primary goal is to update the inventory of small mammals in the region by identifying species and analyzing their spatial and ecological distributions. Additionally, the project aims to assess the role of these species as reservoirs of Leishmania and other potentially zoonotic parasites, as well as their involvement in the transmission of these pathogens.
To achieve these goals, live trapping methods will be employed to capture small mammals. Morphological analyses will be conducted using micro-CT imaging, enabling detailed studies of anatomical features. For species that are challenging to identify morphologically, DNA analysis will be utilized to confirm species identification. Molecular techniques, including PCR (Polymerase Chain Reaction), will be employed to detect Leishmania and other parasites in nuclear and mitochondrial DNA samples. Parasitological analyses will include the extraction and identification of protozoa and helminths associated with the small mammals.
This research will update the inventory of small mammals and their parasites in the Ghardaïa region, providing valuable data on their distribution and ecology. The identification and analysis of Leishmania and other parasites in these species will enhance understanding of their roles as potential reservoirs and vectors. These findings will contribute to a deeper understanding of ecological and parasitic interactions in this endemic area and support the development of strategies to manage related public health risks.