Studium interakcí časných proteinů polyomavirů s buněčnými proteiny
Název práce v češtině: | Studium interakcí časných proteinů polyomavirů s buněčnými proteiny |
---|---|
Název v anglickém jazyce: | Study of interactions of polyomavirus early proteins with cellular proteins |
Klíčová slova: | polyomavirus, časný protein, velký T antigen, proteinová interakce, replikace viru |
Klíčová slova anglicky: | polyomavirus, early protein, large T antigen, protein interaction, virus replication |
Akademický rok vypsání: | 2024/2025 |
Typ práce: | diplomová práce |
Jazyk práce: | čeština |
Ústav: | Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140) |
Vedoucí / školitel: | Mgr. Vojtěch Šroller, Ph.D. |
Řešitel: | skrytý![]() |
Datum přihlášení: | 25.11.2024 |
Datum zadání: | 25.11.2024 |
Datum potvrzení stud. oddělením: | 03.12.2024 |
Forma studia: | prezenční |
Předběžná náplň práce |
Po vstupu polyomaviru do buňky dochází nejprve k produkci virových časných proteinů. Jedná se o malý a velký nádorový antigen (small and large tumour antigen, ST and LT), u některých polyomavirů i střední antigen (middle T, MT). Časné virové proteiny jsou multifunkční proteiny, které se podílejí na regulaci virové replikace a některých buněčných drah. Ko-imunoprecipitací a hmotnostní spektrometrií jsme získali soubor buněčných proteinů, které interagují s LT antigenem myšího polyomaviru. Náplní diplomové práce bude ověřit některé z těchto interakcí mezi LT a buněčnými proteiny. Jedná se například o buněčný protein Baf57, který je součástí komplexu remodelujícího chromatin. Pro ověření interakce budou použity metody imunofluorescenčního barvení, konfokální mikroskopie a imunodetekce. Vliv této interakce na virový infekční cyklys bude sledován s použitím buněk, kde je exprese proteinu Baf57 snížena nebo potlačena. Průběh virového infekčního cyklu bude sledován metodami imunoflurescence a qPCR. |