Rychlost, s jakou se vyvíjí sekvence mitochondriálních genomů, se výrazně liší i mezi poměrně příbuznými druhy, např. mezi různými řády ptáků. Tuto variabilitu vysvětluje celá řada hypotéz, vztahujících se k metabolismu, generačnímu času, velikosti populace, či koevoluci mezi mitochondrií a jádrem. Jednotlivé navržené mechanismy se liší tím, na jakých časových a fylogenetických škálách se uplatňují, tj, zda jsou zodpovědné za rychlejší či pomalejší evoluci v celé velké skupině organismů, nebo by se měly projevovat na populační úrovni v rámci druhu. Cílem práce bude ucelený přehled hypotéz vysvětlujících variabilitu v substituční rychlosti mitochondriálních genomů se zhodnocením jejich možného významu pro variabilitu na kratších časových škálách (zhruba od čeledi do druhu).
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
The rate, at which the sequence of the mitochondrial genomes evolves, may substantially differe even between relatively closely realted taxa, e.g. between orders of birds. The rate variability may be explained by a range of hypotheses, proposing dependence on metabolic rates, generation time, population size, or a mito-nuclear coevolution. The suggested mechanisms differ in the phylogenetic scale ofn which they supoosedly act, i.e. whether they operate within a whole clade or among populations of a single species. The aim of the thesis is a comprehensive overviw of the hypotheses explaining the varibility in mitochondrial substitution rates and evaluation of their possible significance for explaining the variability on relative short time scales (roughly from the family to species level).
