Teoretická část práce bude zahrnovat rešerši na téma izolace a detekce cirkulující nádorové DNA (ctDNA) z mimotělních tekutin, především z moči a využití této ctDNA nesoucí nádorově specifické mutace při záchytu a monitorování onkologických onemocnění, především kolorektálního karcinomu (CRC). V rámci experimentální části práce bude vyšetřována přítomnost ctDNA ve vybraných vzorcích moči pacientů s pokročilým CRC, u kterých byla detekována ctDNA v periferní krvi (resp. plazmě). A to s využitím metody testování ctDNA založené na principu PCR s tvorbou heteroduplexů a následném rozdělení "wild type" a mutovaných fragmentů DNA pomocí denaturační kapilární elektroforézy (DCE). Tato metoda je v laboratoři výzkumného ústavu Genomac běžně používána pro vyšetřování ctDNA v plazmě. Cílem práce je ověřit úspěšnost analýzy ctDNA ze vzorků moči a získaná data porovnat s výsledky testování ctDNA ze vzorků plazmy. Smyslem je možnost provádět testování ctDNA z odběru moči, který je, ve srovnání s odběrem krve, pro pacienta výrazně méně zatěžující.
- zadáno a potvrzeno stud. odd.