Analýza videa pro entomologii
| Název práce v češtině: | Analýza videa pro entomologii |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Video analysis for entomology |
| Klíčová slova: | analýza videa, drosophila, sledování objektů |
| Klíčová slova anglicky: | video analysis, drosophila, object tracking |
| Akademický rok vypsání: | 2016/2017 |
| Typ práce: | bakalářská práce |
| Jazyk práce: | čeština |
| Ústav: | Katedra softwaru a výuky informatiky (32-KSVI) |
| Vedoucí / školitel: | RNDr. Josef Pelikán |
| Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
| Datum přihlášení: | 31.03.2017 |
| Datum zadání: | 04.04.2017 |
| Datum potvrzení stud. oddělením: | 11.04.2017 |
| Datum a čas obhajoby: | 20.06.2017 00:00 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 18.05.2017 |
| Datum odevzdání tištěné podoby: | 19.05.2017 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 20.06.2017 |
| Oponenti: | Ing. Jan Schier, Dr. |
| Zásady pro vypracování |
| Prostudovat literaturu o zpracování videa, zejména sledování malých objektů s cílem segmentovat a sledovat jedince druhu Drosophila na záznamech laboratorních kamer. Najít vhodnou knihovnu podporující rychlé zpracování videa, pokusit se použít AForge.NET.
Cílem práce je navrhnout a implementovat systém pro maximálně automatickou segmentaci a sledování hmyzích jedinců ve videu natočeném v laboratorních podmínkách. Podmínky upřesní zájemce o aplikaci: Laboratoř molekulární genetiky, Entomologický ústav, Biologické centrum AV ČR. Předpokládané funkce budou: postprocessing pořízeného videa, definice oblasti zájmu i parametrů jedinců, jejich dlouhodobé sledování, řešení problémů s překrýváním (join/split), ukládání výsledků do vhodného formátu a případně pokus o následnou analýzu nasbíraných dat. Použité algoritmy, metody a datové formáty by měly být v práci dobře dokumentovány a funkčnost vyvinuté aplikace musí být ověřena na reálných datech z entomologické laboratoře. |
| Seznam odborné literatury |
| 1. R. C. Gonzales, R. E. Woods: Digital Image Processing, 3rd edition, Prentice Hall, 2008
2. M. S. Grewall, A. P. Andrews. Kalman Filtering. Theory and Practice. Prentice Hall, 1993 3. AForge.NET library, http://www.aforgenet.com/framework/ |