Stratifikace pacientů s nádorem močového měchýře na základě průtokově cytometrické alternativy k analýze imunoskóre

• Název práce v češtině: Stratifikace pacientů s nádorem močového měchýře na základě průtokově cytometrické alternativy k analýze imunoskóre
• Název v anglickém jazyce: Bladder carcinoma patient stratification based on flow cytometric alternative to immunoscore analysis
• Klíčová slova: imunoskóre, karcinom močového měchýře, průtoková cytometrie, stratifikace pacientů, nádor-infiltrující lymfocyt, nádorové mikroprostředí, stroma
• Klíčová slova anglicky: immunoscore, bladder carcinoma, flow cytometry, patient stratification, tumor infiltrating lymphocyte, tumor microenvironment, stroma
• Akademický rok vypsání: 2016/2017
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Karel Drbal, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 26.11.2016
• Datum zadání: 29.11.2016

Předběžná náplň práce

Cílem této diplomové práce je cytometrická analýza vzorků nádorů močového měchýře se zaměřením na detekci infiltrujících imunitních buněch všech typů. Zaměřená je na průtokově cytometrickou alternativu zavedených mikroskopických technik a jejich srovnání.
Výsledkem má být kvantitativní porovnání různých klinických stádií ("TNM stage"/"grade") vzhledem k zastoupení subpopulací imunitních buněk. Pro získání poziční informace těchto buněk v nádoru se bude práce snažit nalézt vhodnou metodickou alternativu.
Kritické zhodnocení standardizačních postupů mezi cytometrií a mikroskopií bude prakticky provedené a v práci hojně diskutované. Práce mimo skupinu Jerome Galona jsou vítané.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

The goal of this thesis is a cytometric analysis of bladder carcinoma (BCa) samples with special attention to tumor infiltrating immune cells of all lineages. It is mainly focused on flow cytometric alternative of established microscopy techniques and their comparison.
The outcome is a quantitative correlation of various clinical stages (TNM staging/grading) with a special attention to the involvement of immune cell subpopulations. The focus on their positional information and the search for an alternative methodology is of particular interest.
Critical evaluation of standardization efforts in both cytometry and microscopy fields will be performed experimentally and finally excessively discussed. Evidence outside the leading group of Jerome Galone is welcome.