Zobrazování fluorescenčně značených mitochondrií metodou Biplane_FPALM
| Název práce v češtině: | Zobrazování fluorescenčně značených mitochondrií metodou Biplane_FPALM |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Imaging of fluorescently labelled mitochondria using Biplane_FPALM microscopy |
| Klíčová slova: | mitochondrie fluorescenční proteiny, mikroskopie, superrozlišení, FPALM |
| Klíčová slova anglicky: | mitochondria, fluorescent proteins, microscopy, superresolution, FPALM |
| Akademický rok vypsání: | 2011/2012 |
| Typ práce: | diplomová práce |
| Jazyk práce: | čeština |
| Ústav: | Fyzikální ústav UK (32-FUUK) |
| Vedoucí / školitel: | prof. RNDr. Jaromír Plášek, CSc. |
| Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
| Datum přihlášení: | 02.11.2011 |
| Datum zadání: | 10.11.2011 |
| Datum potvrzení stud. oddělením: | 15.12.2011 |
| Datum a čas obhajoby: | 27.05.2013 00:00 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 11.04.2013 |
| Datum odevzdání tištěné podoby: | 11.04.2013 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 27.05.2013 |
| Oponenti: | prof. RNDr. Jan Valenta, Ph.D. |
| Konzultanti: | RNDr. Petr Ježek, DrSc. |
| Zásady pro vypracování |
| 1.Seznámit se s principem metody Biplane FPALM a zvládnout obsluhu unikátního zařízení nacházejícího se ve Fyziologickém ústavu AVČR.
2.Seznámit se se software pro 3D vizualizace Amira (Visage Inc.) a zvládnout jeho použití při vizualizaci a určení parametrů mitochondriálních sítí a endoplasmatického retikula. 3.Podílet se na přípravě buněk s PCFP markery pro vizualizaci endoplasmatického retikula a mitochondriálních sítí a seznámit se makromolekulárními charakteristikami těchto markerů. 4.Provést studii zaměřenou na zobrazování mitochondrií s PCFP markerem vnější a vnitřní membrány a pokusit se definovat podmínky, za kterých je možné spolehlivě vizualizovat vnější membrány mitochonrií jako uzavřené 3D plochy 5.Provést studii zaměřenou na vizualizaci endoplasmatického retikula s PCFP markery |
| Seznam odborné literatury |
| 1.Alberts, B. et al., Ed. (2002) Molecular Biology of the Cell, Fourth Ed., Garland science, New York.
2.Goldman, R.D., Spector, D.L. Eds. (2005) Life cell imaging. A laboratory manual. Cold Spring Harbor Lab. Press, Cold Spring Harbor, New York. 3.Toomre, D., Bewersdorf, J. (2010) A new wave of cellular imaging. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 26: 285–314. 4.Huang, B. (2010) Super-resolution optical microscopy: multiple choices. Curr. Opinion Chem. Biol. 14:10–14. 5.Juette, M.F. et al. (2008) Three-dimensional sub-100 nm resolution fluorescence microscopy of thick samples. Nat. Methods 5: 527–529. 6.Mlodzianoski, M.J. et al (2011) Sample drift correction in 3D fluorescence photoactivation localization microscopy. Opt. Express 19: 15009-15019. 7.Další časopisecká literatura dle pokynů vedoucího a konzultanta. |