Metody statistické inference založené na matici vzdáleností
| Název práce v češtině: | Metody statistické inference založené na matici vzdáleností |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Distance-based testing |
| Klíčová slova: | nepodobnost, testování založené na nepodobnostech, mnohorozměrná analýza, Mantelův test, test ANOSIM, test MRPP |
| Klíčová slova anglicky: | dissimilarity, distance-based analysis, multivariate analysis, Mantel test, ANOSIM test, MRPP test |
| Akademický rok vypsání: | 2009/2010 |
| Typ práce: | diplomová práce |
| Jazyk práce: | čeština |
| Ústav: | Katedra pravděpodobnosti a matematické statistiky (32-KPMS) |
| Vedoucí / školitel: | doc. Ing. Marek Omelka, Ph.D. |
| Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
| Datum přihlášení: | 12.10.2009 |
| Datum zadání: | 12.10.2009 |
| Datum a čas obhajoby: | 07.09.2011 00:00 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 03.08.2011 |
| Datum odevzdání tištěné podoby: | 04.08.2011 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 07.09.2011 |
| Oponenti: | prof. RNDr. Arnošt Komárek, Ph.D. |
| Zásady pro vypracování |
| Posluchač(ka) se seznámí s existujícími metodami testování statistických hypotéz, kde vstupem
je matice vzdáleností a pomocí simulací (a dle možnosti i analytických metod) prozkoumá postupy navržené v literatuře. |
| Seznam odborné literatury |
| Anderson, M. J. (2006). Distance-based tests for homogeneity of multivariate dispersions. Biometrics, 62:245-253.
Legendre, P. and Anderson, M. J. (1999). Distance-based redundancy analysis: testing multispecies responses in multifactorial ecological experiments. Ecol. Monogr., 69:1-24. Legendre, P. and Legendre, L. (1998). Numerical Ecology. Elsevier Science, Amsterdam. McArdle, B. H. and Anderson, M. J. (2001). Fitting multivariate models to community data: A comment on distance-based redundancy analysis. Ecology, 82:290-297. Mielke, P. W. and Berry, K. J. (2007). Permutation Methods, A distance function Approach. Springer, New York. Warton, D. I. and Hudson, H. M. (2004). A manova statistic is just as powerful as distance-based statistics, for multivariate abundances. Ecology, 85:858-874. |
| Předběžná náplň práce |
| Často je velmi obtížné najít realistický parametrický model pro mnohorozměrná data jako např. při zpracování TRFLP profilů či dat získáná pomocí microarrays. V těchto případech se data redukují na matici vzdáleností
(všech dvojic), která je mimojiné základem (v biologii a lékařství oblíbené) shlukové analýza. Ta však nedává odpověď na velmi mnoho otázek a její výstup je vpodstatě pouze grafický. V průběhu času bylo navrženo několik metod, jak testovat hypotézy na matici vzdáleností. Chybí však solidní výzkum vlastností těchto metod. |