Převážná většina lidských rakovinných onemocnění je spojena s genetickou nestabilitou, jenž je považována za předpoklad vedoucí v přerodu normální buňky v prekurzorovou rakovinnou buňku. Je známo, že chronická infekce patogenní bakterii Helicobacter pylori způsobuje poškození DNA. Hlavním cílem projektu bude identifikovat jestli infekci indukované poškození DNA vzniká jako důsledek nadměrného replikačního stressu (t.j. situace, kdy dochází k zastavení či zpomalení postupu replikačních vidlic), který je detekován již v pre-rakovinných buňkách. Zastavení replikační vidlice postupujícím transkripčním komplexem nebo ko-transkripčním RNA:DNA hybridem, tzv. R-smyčkou, muže mít za následek přeskupení chromozomů, zvláště pokud k takovéto kolizi dojde v tzv. běžných fragilních místech (common fragile sites, CFSs). Nabízí se atraktivní hypotéza, že tvorba R-smyček přispívá k poškození DNA pozorovanému v buňkách infikovaných patogenními bakteriemi.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
The vast majority of human cancers are associated with genomic instability, which is a prerequisite for the transformation of a normal cell into a precursor cancerous cell. Chronic infections by pathogenic bacteria Helicobacter pylori are known to induce DNA damage. The main aim of the project is to identify whether the infection-induced DNA damage arises as a result of excessive replication stress (referred to a situation, when replication fork progression is paused or slowed down), which could be frequently detected in pre-cancerous cells. Stalling of replication fork progression by ongoing transcription elongation complex or by co-transcriptional RNA:DNA hybrid (R-loop) might result in chromosome rearrangements, especially if a transcription-replication collision occurs at the difficult-to-replicate genome loci, such as common fragile sites. The attractive hypothesis is suggested that R-loop formation contributes to the DNA damage observed in the cells infected by pathogenic bacteria.
- zadáno a potvrzeno stud. odd.