Hodnocení záchytu abnormálních genetických variant metodami cytogenomiky u jedinců s poruchami autistického spektra

• Název práce v češtině: Hodnocení záchytu abnormálních genetických variant metodami cytogenomiky u jedinců s poruchami autistického spektra
• Název v anglickém jazyce: Evaluation of the detection of abnormal genetic variants by cytogenomic methods in individuals with autism spectrum disorder
• Klíčová slova: Poruchy autistického spektra (PAS), varianty v počtu kopií (CNV), neurovývojová onemocnění (NVO), array komparativní genomová hybridizace (array CGH)
• Klíčová slova anglicky: Autism spectrum disorders (ASD), copy number variants (CNVs), neurodevelopmental disorders (NDD), array comparative genomic hybridization (array CGH)
• Akademický rok vypsání: 2023/2024
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra antropologie a genetiky člověka (31-110)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Zuzana Slámová, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 09.11.2023
• Datum zadání: 09.11.2023
• Datum potvrzení stud. oddělením: 22.01.2024
• Datum odevzdání elektronické podoby: 29.04.2025
• Datum proběhlé obhajoby: 04.06.2025
• Oponenti: Mgr. Karla Svobodová, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Porucha autistického spektra (PAS) představuje skupinu heterogenních genetických neurobehaviorálních poruch spojených s abnormálním vývojem sociálně komunikačních dovedností a zahrnujících stereotypní, rigidní nebo opakující se chování. Autismus postihuje asi 2 % dětí s poměrem mužů k ženám 4:1. Příčiny PAS jsou komplexní se zastoupením jak genetických a epigenetických faktorů, tak i působení vnějšího prostředí. Odhadovaná míra dědičnosti této neurovývojové poruchy je mezi 70 a 90 %.
Odhaduje se, že u 50 % jedinců s ASD je identifikována delece nebo duplikace genetického materiálu (CNV), některý ze známých syndromů nebo monogenní porucha. Vyšetření metodami cytogenomiky, zejména metodou array CGH, je proto považováno za genetický test prvního stupně.
Diplomový projekt Bc. Markéty Dvořákové bude vypracován v cytogenetických laboratořích Ústavu biologie a lékařské genetiky 2. LF UK a FN v Motole pod dohledem zkušených pracovníků. V rámci projektu bude zhodnocen záchyt abnormálních a patogenních variant u souboru pacientů s PAS metodami konvenční i molekulární cytogenomiky s důrazem na vyšetření array CGH. Data prospektivní studie (2024 - 2025) budou dále doplněna o retrospektivní data pacientů s PAS vyšetřených na domovském pracovišti v letech 2022 - 2023 a statisticky zhodnocena. Získané výsledky budou následně porovnány s dostupnými publikovanými studiemi.
Cílem představovaného projektu je přispět k lepšímu pochopení etiologie PAS a k optimalizaci vyšetřovacího postupu a ke zvýšení efektivity odhalování genetických příčin tohoto dědičného postižení.